Asia 1型口蹄疫病毒VP1蛋白进化踪迹分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛银杰

作者： 牛银杰;王靖飞

作者机构：

关键词： Asia 1型口蹄疫病毒;VP1蛋白;踪迹进化分析;同源建模

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2014 年 36 卷 8 期

页码： 615-619

收录情况： CSCD

摘要： 为预测口蹄疫病毒(FMDV) VP1蛋白的重要功能残基,本研究利用进化踪迹及蛋白结构同源建模等方法对91株Asia 1型FMDV的VP1氨基酸序列进行分析,结果显示91个病毒株分属于B、C和D分支,2005年~2006年分离株处于另一个分支,命名为E分支.以10分区分析进化树,共34个组特异残基,其中~(140)S、~(141)S、~(146)L、~(148)A、~(149)L、~(150)A、~(151)R、~(152)R、~(153)V、~(155)N和~(156)R分布于G-H环区域,预测它们与抗原性和受体结合特性有关;B、C、D和E4个分支的组内特异残基分别为~(24)S、~(153)G、~(196)H; ~(59)H、~(141)P、~(146)M、~(150)S、~(169)N; ~(50)I、~(135)A和~(99)N、~(127)S、~(140)S、~(151)R,这些残基为各分支的分子标识;组特异残基~(35)V、~(80)L、~(93)S、~(127)A分布于VP1和其他结构蛋白的作用界面,可能对病毒的装配具有重要作用.本研究结果为FMDV的VP1功能研究提供了参考数据.

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