基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨驰

作者： 杨驰;马璐;肖冬来;江晓凌;刘晓瑜;林衍铨

作者机构：

关键词： 绣球菌;基因组;测序;单核苷酸多态位点;小片段插入缺失

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2021 年 012 期

页码： 3246-3255

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求。绣球菌新品种‘SP-A’是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究。本研究利用高通量测序技术,对‘SP-A’全基因组进行测序,获得了1.58Gb高质量测序数据,Q30达到95.55%。与‘闽绣1号’参考基因组平均比对率为76.86%,平均覆盖深度为28X,基因组覆盖度为93.51%,共检测到273587个单核苷酸多态位点,40772个小片段插入缺失位点,这些变异共导致了7954个基因变异。研究初步揭示了‘SP-A’的基因组特征,为相关分子标记筛选及辅助育种、遗传分析和功能基因克隆提供了重要的分子标记资源。

分类号： S646

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