尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 畅引东

作者： 畅引东;贾仡伟;何瑞;张萌;孟广军;李新凤;张作刚;王建明

作者机构：

关键词： microRNA-like RNA;初级milRNA;蛋白互作网络;尖孢镰孢菌;靶基因

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 102-112

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]MicroRNA通过调控其靶基因在生物活动中起到重要的作用，本研究目的是为了明确尖孢镰孢菌与番茄互作早期相关milRNAs的分子功能及调控机制。[方法]采用实时荧光定量PCR法对尖孢镰孢菌番茄专化型菌株侵染寄主早期pri-milRNAs和milRNAs靶基因进行基因表达分析，利用STRING蛋白互作网络数据库和Cytoscape软件预测该菌株milRNAs与靶基因间的蛋白互作网络，并结合DAVID在线分析工具对相关基因进行生物学功能分析。[结果]实时荧光定量PCR结果表明，供试的pri-milRNA＿2a和pri-milRNA＿2b与FOXG＿03470、pri-milRNA＿3b与FOXG＿04910、pri-milRNA＿4与FOXG＿08812、pri-milRNA＿6与FOXG＿00067表达趋势基本相反，4个miLRNA与相应基因可能存在靶标关系；蛋白互作网络预测结果可知，尖孢镰孢菌fox＿milRNA＿1、fox＿milRNA＿2、fox＿milRNA＿3和fox＿milRNA＿8的靶基因间互作较为紧密。其中，fox＿milRNA＿1的靶基因FOXG＿04240与fox＿milRNA＿2的靶基因FOXG＿03470能够同该蛋白互作网络中诸多的基因进行互作，推测为该蛋白互作网络中的枢纽基因；该蛋白互作网络主要分子功能为氧化还原酶活性，主要参与的生物学过程为小GTP酶介导的信号转导。fox＿milRNA＿3的靶基因FOXG＿04910可通过调节Rho基因影响菌株的生长，推断其和菌株与寄主的信号识别和菌株在寄主中定植有关。[结论]本研究通过试验验证和生物信息学预测发现，尖孢镰孢菌侵染番茄初期，存在milRNAs及其下游靶基因的调控网络。上述结果为进一步深入研究尖孢镰孢菌milRNA的功能提供一个新思路。

分类号： S436.412.1

  • 相关文献

[1]基于转录组测序数据的青稞WRKY基因家族的生物信息学分析. 蒋礼玲,陈丽华,尼玛扎西,马晓岗,黄胜雄,李高原. 2021

[2]害虫对Bt杀虫蛋白抗性相关受体蛋白互作网络分析. 王奎,王泽宇,束长龙,张杰. 2021

[3]猪精子发生候选基因PYGO2的分离、表达和亚细胞定位研究. 赵筱,张霞,范俐,杨忠,霍金龙,曾日彬,刘丽仙,霍海龙. 2021

[4]基于网络药理学分析消黄散治疗马火热壅盛证作用机制的研究. 白东东,李新圃,杨峰,罗金印,王旭荣,王丹,张亚茹,李宏胜. 2018

[5]尖镰孢菌和禾谷镰孢菌引起的大豆根腐病生物防治研究. 张红骥,Allen G.Xue,Jinxiu Zhang,许艳丽,于德才. 2011

[6]款冬花根腐病的发病情况与病原鉴定. 张爱香,马海莲,李雪萍,仝在利,李世东,王晓涛. 2011

[7]黄瓜抗感材料接种尖孢镰孢菌后根系游离氨基酸的差异分析. 李亚莉,侯栋,岳宏忠,张东琴. 2019

[8]万寿菊秸秆用于苹果连作土壤生物修复材料的潜力. 王晓芳,赵玉文,王玫,王海燕,盛月凡,尹承苗,陈学森,毛志泉. 2019

[9]番茄颈腐根腐病病原鉴定及其品种抗性鉴定. 李潇,李雪萍,漆永红,郭成,李敏权. 2019

[10]尖孢镰孢菌对抗病和感病黄瓜幼苗生长及叶片游离氨基酸的影响. 李亚莉,侯栋,岳宏忠,张东琴. 2019

[11]根腐病对党参细胞结构和生理特性的影响. 徐美蓉,李敏权,曹素芳,蒋晶晶,李雪萍,孙新荣,陈爱昌,李继平,漆永红. 2020

[12]甘肃省定西市芹菜根腐病发生及病原优势种类分析. 张敏,罗宁,陈爱昌,李焕宇,刘永刚,李惠霞,石明明,韩变. 2022

[13]京津冀设施大棚根际土壤中筛选出的防治根腐病的生防镰孢菌. 张怡静,康舒雨,房庆,张雅静,宋美燕,彭德良,杨俊,孔令安. 2021

[14]河南省一例西瓜死苗现象的病原鉴定. 梁慎,徐小利,赵卫星,常高正,李晓慧,杨帆,陈丽丽,李文静. 2014

[15]甘肃大葱贮藏期镰孢菌腐烂病病原鉴定. 张军高,漆永红,郭成,苏建红,李敏权,李雪萍,曹素芳,刘丹. 2016

[16]棉花枯萎病菌新生理型菌株的分子鉴定. 郭庆港,王培培,鹿秀云,董丽红,赵卫松,张晓云,李社增,马平. 2018

[17]葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测. 王丽丽,葛金涛,刘兴满,赵统利. 2016

[18]草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析. 张馨宇,戚华彩,董向向,李贺,张志宏. 2016

[19]microRNA在植物生长发育中的作用. 刘海丽,丁艳菲,潘家荣,江琼,王光钺,朱诚. 2013

[20]特异性靶基因在弧菌PCR快速检测中的应用. 邵蓬,汪笑宇,徐晓丽. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序