茯苓菌落褐变的转录组测序分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 蔡丹凤
作者: 蔡丹凤;蔡志欣;陈美元;林衍铨
作者机构:
关键词: 茯苓;褐变;转录组测序
期刊名称: 广州中医药大学学报
ISSN: 1007-3213
年卷期: 2017 年 02 期
页码: 245-249
摘要: 【目的】探究中药茯苓菌落褐变的相关基因,为进一步验证茯苓菌丝褐变相关基因及探讨其分子机理奠定基础。【方法】对茯苓正常与褐变菌丝体共4个样品的转录组进行测序,并与茯苓参考基因组进行序列比对,并基于比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析。【结果】共鉴定到12 383个转录本,发掘新基因1 017个,其中260个得到功能注释;发现正常菌落与3个不同程度褐变菌落有336个共同差异基因。【结论】茯苓菌落褐变的转录组测序分析发现系列差异表达基因,部分基因的表达量倍数差异达到数百倍甚至上千倍,它们的相关功能值得进行深入分析。
分类号: S567.32
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