从大麦白粉菌EST数据库开发小麦白粉菌SSR分子标记

文献类型： 中文期刊

第一作者： 许韬

作者： 段霞瑜;周益林

作者机构：

关键词： 小麦白粉菌;SSR;EST;多态性

期刊名称： 植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集

ISSN：

年卷期： 2011 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 利用已发布的大麦白粉菌EST数据库中的SSR重复序列,开发可用于小麦白粉菌的EST-SSR分子标记,为小麦白粉菌的群体遗传学、分子生物学、分子流行学研究奠定基础。从NCBI公共数据库中随机抽取18296条大麦白粉菌表达序列标签(expressedsequencetag,EST),应用SSRIT软件进行序列搜索。搜索标准为二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复序列,最少重复次数分别为六次、四次、三次、三次、三次。共获得896条具微卫星序列的大麦白粉菌EST序列,其中包括二核苷酸重复80条(8.93%),三核苷酸重复280条(31.25%),四核苷酸重复462条(51.56%),...

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