鸭疫里默氏杆菌RiaR基因缺失株的构建及其生物学特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于永峰

作者： 于永峰;陈启伟;权衡;刘东慧;李彩玉;宫晓炜;储岳峰

作者机构：

关键词： 鸭疫里默氏杆菌;RiaR;转录组;代谢调控

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 476-484

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 全基因组测序及生物信息学分析表明，鸭疫里默氏杆菌RA-LZ01株中存在1对新的双组分调控系统（two-component regulatory systems,TCS）RiaR/RiaS，且在黄杆菌目中高度保守。为探讨RiaR/RiaS在鸭疫里默氏杆菌中的作用，采用同源重组和结合转移的方法构建反应调节器RiaR的基因缺失株RAΔRia R和回补株RAcΔRia R，并比较了它们与亲本株RA-LZ01在生长、抗生素敏感性和毒力方面的生物学特性差异；通过RA-LZ01和RAΔRia R的原核转录组测序，进一步分析RiaR所发挥的生物学功能。结果显示，与亲本株相比，RAΔRia R在其生长、抗生素敏感性和毒力方面并无明显差异。转录组分析表明，从RAΔRia R中筛选到203个差异基因[lb（FC）值的差异倍数≥2且P＜0.05]均为显著上调的基因，提示RiaR/RiaS是1对负调控下游基因表达的TCS。COG分析结果显示，富集程度最高的差异基因为功能未知的基因（50个，19%），其次为氨基酸运输和代谢相关基因（29个，11%）。KEGG的分析结果显示，差异基因主要富集于代谢相关的通路（116个，77.8%），包括氨基酸代谢（29个，19.4%）、核苷酸代谢（14个，9.3%）、碳水化合物代谢（23个，15.4%）等14个代谢相关的子通路。因此，验证了鸭疫里默氏杆菌中RiaR基因的生物学功能，为深入探究该TCS参与鸭疫里默氏杆菌的代谢调控提供依据。

分类号： S852.61

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