甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王廿

作者： 王廿;鄢锦辉;张开春;王晶;张晓明;闫国华

作者机构： 北京市农林科学院林业果树研究所

关键词： 甜樱桃;DFR基因;果皮颜色;等位基因频率;基因多态性

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2012 年 45 卷 02 期

页码： 320-329

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究70个甜樱桃品种DFR基因多态性与果皮颜色的相关性。【方法】通过DNA序列分析,以不同果皮颜色的10个甜樱桃品种(Prunus avium L.)为材料,检测DFR基因的多态性。根据多态性出现的位点设计特异引物,通过PCR扩增检测70个甜樱桃品种DFR基因的多态性。【结果】获得甜樱桃DFR基因约1 kb的片段,测序结果用BLAST分析发现,其核苷酸序列与樱桃李(Prunus cerasifera)的核苷酸相似性为80%,预测的氨基酸序列与已知的甜樱桃(P.avium)DFR氨基酸序列相似性达99%。该片段由3个外显子和3个内含子组成,2个多态性位点分别在内含子2和内含子3上。在黄色、黄底红晕和红色果皮3个组的70个甜樱桃品种中发现3个单倍型,共5种单倍型组合。通过SAS 9.0软件分析发现,所检测到的DFR基因的等位基因频率在黄底红晕果皮品种组和红色品种果皮组中的分布无显著差异。【结论】本研究在甜樱桃DFR基因座上得到2个差异位点,分别在内含子2和内含子3内,其优势基因频率依次为:0.864和0.679;但未发现DFR基因内含子2和内含子3的多态性与果皮颜色之间存在直接关系。

分类号： S662.5

  • 相关文献

[1]6个甜樱桃品种ACO基因多态性的检测. 王廿,张开春,王晶,张晓明,闫国华. 2012

[2]红花石榴二氢黄酮醇还原酶(DFR)基因cDNA片段克隆及序列分析. 招雪晴,苑兆和,陶吉寒,尹艳雷,冯立娟. 2012

[3]刺葡萄DFR基因克隆及生物信息学分析. 赖呈纯,黄贤贵,甘煌灿,潘红,范丽华. 2016

[4]朵丽蝶兰二氢黄酮醇4-还原酶基因DtpsDFR的克隆与表达分析. 钟淮钦,黄敏玲,吴建设,樊荣辉,林兵. 2014

[5]刺葡萄DFR基因植物表达载体构建及转化茉莉花愈伤组织的研究. 甘煌灿,赖呈纯,潘红,朱育菁. 2018

[6]矮牵牛PhDFR基因和抗除草剂Bar基因植物表达载体的构建及对烟草的遗传转化研究. 曾闻,肖向文,刘海峰,王俊铎,罗城,李晓波,郑巨云. 2014

[7]甘薯二羟基黄酮醇还原酶基因的克隆及在大肠杆菌中的表达. 赵宝杰,侯夫云,王庆美,李爱贤,张立明. 2008

[8]石榴DFR基因的同源克隆及分析. 陶吉寒,招雪晴,苑兆和,尹燕雷,冯立娟. 2013

[9]鸡Mx基因编码序列1892位SNP及其等位基因的确定. 金丽娜,韩建林,罗玉柱. 2009

[10]绵羊FecB基因的基因分型检测. 王勇,马丽娜,梁小军. 2020

[11]影响猪生长和肉质性状的显著SNP在大约克和长白群体内的多态性分析. 王彦平,王怀中,姜运良,郭建凤,王继英. 2016

[12]一种新的害虫抗性等位基因频率快速分子检测技术:实时荧光定量特异性等位基因PCR(rtPASA). 芮昌辉,任龙,张靖. 2012

[13]新疆冬小麦地方品种高分子量麦谷蛋白亚基的地理分布及其新发现亚基的特性(英文). 丛花,池田达哉,高田兼则,谷中美贵子,藤卷宏,长峰司. 2011

[14]绵羊多羔主效基因FecB高通量检测方法的建立及应用. 刘秋月,胡文萍,贺小云,潘章源,郭晓飞,冯涛,曹贵玲,黄冬维,贺建宁,狄冉,曹晓涵,王翔宇,储明星. 2017

[15]FecB基因与滩羊和湖羊杂交后代产羔数的相关性研究. 马丽娜,于洋,侯鹏霞,施安,梁小军. 2021

[16]利用17个微卫星标记分析鳙鱼的遗传多样性. 耿波,孙效文,梁利群,欧阳洪生,童金苟. 2006

[17]绵羊主效基因FecB的检测与肉用多羔核心群的建立. 张壮彪,刘秋月,狄冉,胡文萍,王翔宇,贺小云,马琳,储明星. 2020

[18]南疆夏河绵羊FecB基因检测及多态性分析. 杨初蕾,徐梦思,郑朝锋,邢佳娟,任宇斓,杨鹏,王立民. 2024

[19]印度南瓜果皮和果肉颜色遗传分析及基因定位. 葛宇,李雪,杨晓霞,徐文龙,崔崇士,屈淑平. 2015

[20]甜瓜果皮颜色遗传分析及基因定位. 欧点点,赵光伟,贺玉花,王平勇,徐志红,孔维虎,张健,徐永阳. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序