养殖刀鲚与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 聂志娟

作者： 聂志娟;徐钢春;程起群;张勇;杜富宽;顾若波

作者机构：

关键词： 刀鲚;细菌菌落;香农指数;PCR-DGGE

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2014 年 38 卷 07 期

页码： 1009-1017

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了分析养殖刀鲚体内与生长环境菌群结构,利用PCR-DGGE技术,对养殖刀鲚鳃、胃、肠壁及肠内容物和养殖水体菌群结构进行了初步分析。PCR-DGGE指纹图谱分离显示,42条清晰条带,其中养殖水体(27)、鳃(9)、胃(13)、肠道壁(19)、肠道内容物(18)的香农指数分别为3.037、1.883、2.193、2.825、2.683;养殖水体与刀鲚鳃、胃、肠道壁及肠道内容物分别具有6、9、11、8共有带。UPGMA聚类分析显示,样品3个重复相似度都在95%以上,差异不明显;不同样品之间,养殖刀鲚鳃和胃聚为一支,具有较高的相似度(76%),同时与养殖水体相似度达29%;养殖刀鲚肠道壁和肠道内容物聚为一支,相似度为38%。回收测定所有显示条带,主要包含变形菌、放线菌、拟杆菌、柔膜菌、蓝藻细菌、厚壁菌、梭杆菌及少量未定义菌种。研究表明,PCR-DGGE技术能区分养殖刀鲚主要部位及水体微生物的结构差异和多样性,澄清养殖刀鲚及生长水体微生物区系,可为定植益生菌的开发提供参考。

分类号： S965.227

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