大菱鲆脾脏cDNA文库构建、EST序列分析与免疫抗病相关基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟亮

作者： 孟亮;陈松林;刘洋

作者机构：

关键词： 大菱鲆;cDNA文库;表达序列标签;免疫相关基因

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2009 年 33 卷 05 期

页码： 3-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以大菱鲆脾脏为材料,构建cDNA文库,通过对文库克隆的序列测定和初步生物信息学分析,共获得3 656个大菱鲆脾脏表达序列标签(EST)。经与GenBank数据库的序列比对后发现,1 891个EST代表了149个已知基因,其余1 765个EST为未知序列。这149个基因大致可分为6类:9个为细胞结构类(6.0%);26个为代谢类(17.5%);45个为细胞防御/免疫类(30.2%);43个为基因/蛋白质表达类(28.9%);16个为细胞信号转导/细胞交流类(10.7%);10个无法明确分类(6.7%)。鉴定的与免疫抗病相关重要基因主要有:CC/CXC趋化因子;主要组织相容性复合体(MHC)class I;αC3补体;天然杀伤细胞增强因子(NKEF);胸腺素β-4/β-12;干扰素诱导蛋白G ig1;白介素8受体;STAT4;热激蛋白70/90等。

分类号： S917.4

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