甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶鹏

作者： 陶鹏;钟新民;李必元;王五宏;岳智臣;雷娟利

作者机构：

关键词： 甘蓝;BoKIN1;表达;ploy(A)位点;ploy(A)频率

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 05 期

页码： 1072-1078

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 多聚腺苷酸化(Polyadenylation)是真核生物中一种重要的pre-mRNA加工机制,是mRNA成熟的一个必经过程。为了解甘蓝BoKIN1基因的多聚腺苷酸化加工情况,本研究从甘蓝全基因组数据库中下载得到BoKIN1基因序列,并利用生物信息学手段分析了BoKIN1的基因结构和基因表达。研究结果显示:BoKIN1基因在花器官中表达最高;然后基于EST文库发现了3个ploy(A)位点,并计算了这些ploy(A)位点在premRNA加工过程中被选择的大致频率情况,结果显示BoKIN1基因在pre-mRNA加工过程中至少有6个ploy(A)位点可供选择加尾,其中AP4位点被选择加尾的频率最高,其次是AP5位点。因此选择AP4位点加尾后形成的mRNA是转录后加工的主要产物。通过本研究我们确定了甘蓝类BoKIN1基因6个选择性加尾位点及其3'UTR的主要产物和次要产物,可对于未来进一步利用这些3'UTR奠定基础。

分类号： S635

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