水稻种质资源全基因组DNA指纹鉴定方法研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马小定

作者： 马小定;崔迪;韩冰;焦成智;韩龙植

作者机构：

关键词： SNP标记;指纹图谱;遗传相似度;实质性派生品种

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 1106-1113

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 开展水稻种质资源DNA指纹鉴定可以赋予每份种质统一的身份信息，对于查清我国资源家底、评估资源遗传基础、提高资源利用效率和保护种业知识产权等具有重要意义。本研究利用已完成全基因组DNA重测序的5374份水稻种质资源为材料，通过参考样本资源的选择、高质量SNP位点分析以及最优SNP数量和SNP组合的挑选，建立了2套水稻种质资源全基因组DNA指纹标准。通过主成分分析和系统进化树分析，指纹标准1和2选择的SNP可以代表94,197个高质量群体共有SNP进行群体遗传多样性检测；群体遗传相似度分析验证了指纹标准1和2对于开展水稻种质资源遗传相似性鉴定的有效性。本研究有望为水稻种质资源保护与利用以及种业知识产权保护等提供技术支撑，并为其他作物制定全基因组DNA指纹鉴定标准提供参考。

分类号： S511

  • 相关文献

[1]基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析. 许乃银,金石桥,晋芳,刘丽华,徐剑文,刘丰泽,任雪贞,孙全,许栩,庞斌双. 2024

[2]利用CottonSNP63K芯片构建棉花品种的指纹图谱. 孙正文,孙正文,匡猛,马峙英,王省芬. 2017

[3]甘蓝SNP标记开发及主要品种的DNA指纹图谱构建. 李志远,于海龙,方智远,杨丽梅,刘玉梅,庄木,吕红豪,张扬勇. 2018

[4]用于羊草基因分型的SNP分子标记技术研究. 侯莉娟,齐晓,齐冬梅,陈双燕,刘公社. 2016

[5]茄子全基因组SNP标记的开发. 肖熙鸥,聂珩,林文秋,吴彩玉. 2025

[6]我国建立实质性派生品种制度的必要性讨论. 陈红,刘平,吕波,张新明,饶智宏,郑金贵,宋敏. 2009

[7]种子企业如何做好植物新品种保护和创新. 郭建强,高雪飞,舍刚,高翔,蔺怀龙,陈微林,姜辉,权永刚,王爱华,梁晓玲. 2023

[8]Maize 6H-60K芯片在玉米实质性派生品种鉴定中的应用分析. 田红丽,张如养,范亚明,杨扬,张云龙,易红梅,邢锦丰,王凤格,赵久然. 2023

[9]实质性派生品种鉴定方法研究进展. 褚云霞,陈海荣,邓姗,黄志城,李寿国. 2017

[10]牙鲆连续两代减数分裂雌核发育家系的遗传特征. 王桂兴,刘海金,张晓彦,刘永新,王玉芬,蒋丽. 2012

[11]我国主推玉米品种亲本的遗传结构解析. 李晶晶,张文洋,王利锋,王浩,李会勇. 2021

[12]罗氏沼虾6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析. 孙成飞,叶星,董浚键,田园园,梁健辉. 2015

[13]基于二代测序技术的MNP标记鉴别刺芹侧耳菌株. 魏传正,王朦,张鹏,刘芳,严俊杰,谢宝贵,邓优锦,谢路昱. 2023

[14]5个罗非鱼群体的遗传分析与分子标记. 杜诚,卢迈新,叶星,劳海华,黄樟翰,白俊杰. 2005

[15]利用SNP标记对100份玉米种质资源的遗传多样性分析. 孙艳杰,魏国才,吴雨恒,石运强,邵勇,刘英蕊,南元涛,张维耀. 2025

[16]基于SNP标记的种子纯度高效检测分析模型的建立. 李欧静,张桂华,兰青阔,王永,赵新,朱珠,陈锐,郭永泽. 2012

[17]利用SNP标记划分46份玉米自交系的杂种优势群. 杨兆顺,袁文娅,许高平,韩小云,孙天齐. 2018

[18]水稻产量分子设计育种研究进展. 张分云,李宏,周向阳,王重荣,周德贵,赖穗春,陈立云,周少川. 2013

[19]甘蓝型油菜每角粒数的全基因组关联分析. 孙程明,陈锋,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2020

[20]甘蓝型油菜角果长度性状的全基因组关联分析. 孙程明,陈松,彭琦,张维,易斌,张洁夫,傅廷栋. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序