基于转录组分析的大针茅响应羊啃食的基因表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田青松

作者： 田青松;田文坦;李婷婷;高金玉;武志娟;韩冰

作者机构：

关键词： 大针茅;羊啃食;转录组测序;实时荧光定量PCR

期刊名称： 中国草地学报

ISSN： 1673-5021

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用新一代高通量测序手段对大针茅受到羊啃食后2h的实验组与未啃食的对照组叶片进行Illumina平台的转录组测序(RNA sequences),共得到147561个序列读取片段(reads),组装成64738条单基因簇(Unigenes),Unigenes平均长度为1367.21bp,N50为2017bp。随机挑选11个基因利用实时荧光定量PCR对转录组数据库进行了验证。基于转录组数据分析淀粉和蔗糖代谢通路中关键调控基因表达差异,结果表明:随机挑选的11个基因的表达差异变化与转录组数据上下调趋势一致,在淀粉与蔗糖代谢通路中相关基因的表达差异变化利于淀粉、蔗糖的积累。大针茅在羊啃食后淀粉与蔗糖含量的增加有利于结实,对后代的传播意义重大。

分类号： S543.9

  • 相关文献

[1]水分胁迫下水稻对褐飞虱转录组的影响. 谭椰,徐文彦,周文武,鹿东东,商晗武,祝增荣. 2017

[2]斜纹夜蛾四龄幼虫暴食相关基因的鉴定和通路分析. 张赞,彭莉舒,李坤,钱坤,相栋,何林. 2021

[3]嘎达苏地区几种主要牧草的营养动态. 冯宗慈,奥德,王志铭,王秀,尹殿明,赵国福,张殿荣. 1997

[4]大针茅根际AM真菌的分子鉴定及不同放牧强度对AM侵染的影响. 曹路,索培芬,韩冰,赵萌莉,海丽丽. 2015

[5]不同放牧强度下内蒙古温带典型草原优势种植物防御策略. 李颖,龚吉蕊,刘敏,侯向阳,丁勇,杨波,张子荷,王彪,朱趁趁. 2020

[6]大针茅对放牧生态系统植物群落地上生物量的调控作用. 胡静,侯向阳,萨茹拉,李西良,王珍,丁勇. 2016

[7]大针茅干旱胁迫下最佳内参基因组合的筛选及验证. 武志娟,王照兰,韩冰,焦志军,赵鸿彬. 2016

[8]大针茅种群氮磷化学计量内稳性对纬度梯度的响应. 吴金蕊,运向军,李飞,春亮,李梦真,吕世杰. 2023

[9]不同改良措施对大针茅植物群落影响的研究. 闫志坚. 2002

[10]利用草层高度管理大针茅草原的方法初探. 安渊,阎志坚. 2002

[11]割草和放牧对大针茅根际与非根际土壤养分和微生物数量的影响. 胡静,侯向阳,王珍,丁勇,李西良,李平,纪磊. 2015

[12]大麦白化颖壳突变体的转录组学分析. 栾海业,臧慧,沈会权,张英虎,乔海龙,陶红,申玉香,陈和. 2017

[13]鄂尔多斯细毛羊羊毛细度和皮肤转录组测序分析. 祁云霞,付绍印,何小龙,王标,达赖,特日格勒,陶萨茹拉,丹巴,刘永斌. 2015

[14]家蚕茧丝相关性状的研究进展. 刘娜,李娟,秦笙,李木旺. 2016

[15]不同海拔下花叶海棠叶片转录组核苷酸变异分析和比较. 张得芳,夏涛,文怀秀,王占林,刘霞,张磊,白灵娜. 2017

[16]茶丽纹象甲为害诱导的茶树防御反应分析. 高香凤,李慧玲,王让剑. 2019

[17]大猿叶甲转录组测序及生物学信息分析. 沙君雪,迟宝岩,张金波,李阳阳,史琛琛,倪鹤嘉,李海涛,高继国. 2018

[18]禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平. 2018

[19]基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜新转录本的鉴定. 徐文,安素妨,王艳,贾琳琳,鲁丹丹,张莹莹,刘建丰,李保全. 2018

[20]双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华,王泽生. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序