基于转录组测序筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 岳山

作者： 岳山;赵秀华;孙金艳;彭福刚;张元良;李满雨;刘国君

作者机构：

关键词： 浙籽鹅F2代;转录组;信号通路;候选基因

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 011 期

页码： 5254-5264

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]以浙东白鹅(♂)与浙籽鹅F1代(♀)杂交产生的浙籽鹅F2代母鹅为研究对象,分析浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液转录组数据,筛选浙籽鹅F2代繁殖性状相关的候选基因,为杂交鹅的繁殖调控提供参考.[方法]采集浙籽鹅F2代产蛋期和休产期血液样本,利用Illumina NovaSeq 6000测序平台进行转录组测序(RNA-Seq)分析.利用DESeq筛选差异表达基因(DEGs),对其进行GO功能和KEGG通路富集分析,筛选与繁殖性状相关的基因.随机挑选6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证.[结果]转录组测序结果显示,在产蛋期与休产期两个比较组中存在差异表达的基因4 576个,其中上调基因1 821个,下调基因2 755个.GO功能富集分析显示,共富集到9 643个GO条目,在生物过程中主要富集在钙离子跨膜转运的正调节、吞噬作用的调节、阳离子跨膜转运的正向调节等条目;在分子功能上主要富集在转移酶活性、催化活性、嘌呤核苷三磷酸结合等条目;在细胞组分中主要富集在细胞内.KEGG通路富集分析显示,共富集到157条通路,主要富集在果糖和甘露糖代谢、烟酸盐和烟酰胺代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢等通路,筛选出ADCY5、CD44、CCND1是与繁殖性状相关的候选基因.实时荧光定量PCR结果与转录组测序趋势相符合,证实转录组测序结果可靠.[结论]本研究通过转录组测序筛选到3个(ADCY5、CD44、CCND1)与繁殖性状相关的候选基因,为研究浙籽鹅F2代繁殖性状相关基因的功能及后续分子调控机制提供依据.

分类号： S835.3

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