建鲤肠型脂肪酸结合蛋白基因的分离及其SNPs与增重的相关分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 夏正龙

作者： 夏正龙;俞菊华;李红霞;李建林;唐永凯;任洪涛;朱双宁

作者机构：

关键词： 建鲤;肠型脂肪酸结合蛋白;组织表达;单核苷酸多态性;SNP-增重相关分析

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2013 年 35 卷 05 期

页码： 628-636

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 文章采用PCR方法从建鲤(Cyprinus carpio var.jian)基因组分离到2个肠型脂肪酸结合蛋白基因(Fatty acid binding protein 2,FABP2),ORF长度均为399 bp,相似度为92.2%,分别记为jlFABP2a、jlFABP2b,和斑马鱼(Danio rerio)FABP2 ORF的相似度分别为88.0%和90.5%。jlFABP2s基因结构与FABPs家族其他成员一致,由4个外显子和3个内含子组成,2a和2b间内含子序列和长度差异明显。系统树显示这2个基因对应斑马鱼的1个FABP2基因,和鲤鱼染色体数是斑马鱼的2倍一致。实时荧光定量PCR结果显示,jlFABP2a、2b在建鲤肠中的表达量极显著高于脑、肝脏、肌肉、肾脏、心脏、性腺等其他组织(P<0.01),且2a表达量显著(雄鱼,P<0.05)或极显著(雌鱼,P<0.01)高于2b,但在其他组织则2b表达量稍高,暗示2a为肠特异性表达,2b则为广谱表达。通过比对8尾建鲤的2a和2b基因序列,在2a和2b上分别找到12个和4个SNP,均位于内含子上。使用PCR-RFLP法检测jlFABP2a上4个SNP位点I1-A15G、I1-A99G、I2-C487T和I3-A27T在建鲤选育群体中的基因型分布,并进行了基因型与个体增重的关联分析,结果表明,4个位点与雌、雄成鱼阶段增重分别有极显著或显著相关。同时考虑4个位点的基因型与增重的关系,结果基因型AGGGCCXX和AGGGXXAT的个体平均增重比其他个体快15%,这两种基因型个体在选育群中占了9%,具有较大的选育空间,可用于建鲤分子育种计划中。

分类号： Q78

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