FMDV OH99株基因组全序列的测定及其基因特征研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘光清

作者： 刘光清;刘在新;张显升;常惠芸;郭慧琛;李冬;刘相涛;谢庆阁

作者机构：

关键词： FMDV;OH99株;分子克隆;非编码区;结构蛋白

期刊名称： 中国病毒学

ISSN： 1003-5125

年卷期： 2003 年 03 期

页码：

收录情况： CSCD

摘要： 采用RT-PCR方法对FMDV OH99株基因组全序列进行了分子克隆与测序。结果表明OH99株基因组全基因组序列长8040nt,其中5’NCR长1026nt,前导蛋白(L)编码区长603nt。该毒株结构蛋白与非结构蛋白编码区的核苷酸序列为6318nt,3’NCR长93nt,其后是poly(A)尾巴,测序结果表明该结构至少含有56个A。应用分子生物学软件,将OH99株与其它参考毒株进行了序列比较,并对其基因特征、推导的氨基酸序列进行了研究分析。结果显示,在分类地位上OH99株归属于O型FMDV,与OTY TW/97具有较高的同源性,而与其他参考毒株的差异性比较大,而且在基因组功能未知区域和3A编码区域具有两处明显的基因片段缺失现象,其中3A编码区缺失30nt,与OTY TW/97株相同,但功能未知区域的缺失状况与OTY TW/97稍有差异。根据VP1基因序列,对OH99株与参考毒株进行了系统发生树分析,分析结果表明OH99株与OTY TW/97株在同一基因型内,其遗传关系最近,而与其毒株遗传关系较远。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]FMDVOH99株基因组全序列的测定及其基因特征研究. 刘光清,刘在新,张显升,常惠芸,郭慧琛,李冬,刘相涛,谢庆阁. 2003

[2]猪繁殖与呼吸综合征病毒GS株非编码区分子克隆及其一二级结构的分析. 马友记,柳纪省,张利. 2008

[3]nhⅠ型鸭病毒性肝炎病毒5'非编码区含有典型的内部翻译起始活性. 刘光清,赵伟,云涛,陈宗艳,李传峰. 2010

[4]猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒反向遗传操作系统的建立及应用. 袁世山,孙志,余丹丹,高飞,吕键,袁海峰,郑海红,谭菲菲,张建武. 2007

[5]表达O型口蹄疫病毒VP1基因的牛疱疹病毒1型重组病毒的构建与鉴定. 任宪刚,薛飞,朱远茂,童光志,王延辉,冯军科,祖立闯,李娇. 2008

[6]口蹄疫病毒OH99株基因组全长cDNA的构建. 刘光清,刘在新,谢庆阁. 2004

[7]型内非编码区嵌合口蹄疫病毒的拯救及生物学特性分析. 韩成昊,李平花,白兴文,包慧芳,卢曾军,孙普,曹轶梅,刘在新. 2013

[8]基于叶绿体DNA变异的山荆子种质遗传多样性和系统演化. 高源,王大江,王昆,丛佩华,张彩霞,李连文,朴继成. 2020

[9]甲基磺酸乙酯诱变烟草的SSR多态性分析. 薄韶云,刘文涛,张渐隆,温亮,曹鹏云,吴新儒,晁江涛,李志远,王大伟,刘贯山. 2019

[10]猪传染性胃肠炎病毒TS株非编码区的克隆及其一二级结构的分析. 李建强,柳纪省,胡永浩. 2005

[11]高致病性PRRSVTJ株和致弱毒TJM株Nsp2测序及结构分析. 王凤雪,温永俊,刘准,冷雪,李真光,武华. 2011

[12]单股正链RNA病毒基因组非编码区结构与功能研究进展. 哲名家,陈宗艳,李传峰,刘光清. 2012

[13]A型鸭肝炎病毒微基因组的构建. 梁瑞英,胡文,李宁,缪秋红,毕庄莉,孟春春,李传峰,陈宗艳,刘光清. 2014

[14]牛病毒性腹泻病毒RNA5'端非编码区的检测与遗传分析研究. 任宪刚,薛飞,李娇,朱远茂,祖立闯,冯军科. 2008

[15]高致病性PRRSV TJ株和致弱毒TJM株Nsp2测序及结构分析. 王凤雪,温永俊,刘准,冷雪,李真光,武华. 2011

[16]新城疫病毒毒力分子机制研究进展. 于洋,封振,何孔旺,仇旭升,丁铲. 2013

[17]禾本科CNS-AFLP标记开发与通用性检测. 刘小静,杨璐,智慧,李伟,李海权,王永芳,尚忠林,刁现民. 2009

[18]猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区序列的反向遗传操作. 高飞,姚火春,孙志,王金勇,袁世山. 2007

[19]斑节对虾细胞周期蛋白Y基因克隆与原核表达. 李伟杰,傅明骏,赵超,郭松,江世贵,周发林,杨其彬,邱丽华. 2015

[20]水稻稻瘟病抗性基因的分子定位及克隆研究进展. 杨勤忠,林菲,冯淑杰,王玲,潘庆华. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序