大豆种子不同发育时期全长均一化cDNA文库的构建

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晨

作者： 李晨;闫晓红;周新安;沙爱华;单志慧;周蓉;魏文辉

作者机构：

关键词： 大豆;cDNA文库;均一化技术;表达序列标签

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2010 年 43 卷 03 期

页码： 462-467

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为获得大豆种子发育相关基因,并为大豆基因组资源提供材料。【方法】采用SMART(switching mechanism at 5′end of RNA transcript)与DSN(duplex-specific nulease)均一化相结合的技术,构建了全长均一化cDNA文库,采用涂平板测定和PCR快速鉴定的技术分析文库质量,用3730测序仪对文库克隆进行测序。【结果】构建了大豆种子不同发育时期全长均一化cDNA文库,最大限度地获得了大豆种子不同发育阶段表达的基因序列,原始文库的库容为6.0×105cfu/mL,重组率接近100%,插入片段大小在0.6—2.0kb之间,平均长度超过1.0kb。经过大规模的质粒提取和测序,共得到了36656条高质量的EST序列,序列的平均读长在600bp以上。【结论】经过EST序列拼接分析,整个文库有着很高的非冗余性。文库的代表性和重组片段的完整性均达到了分离筛选目的基因的建库要求。

分类号： S565.1

  • 相关文献

[1]柞蚕蛹全长cDNA文库的构建和随机EST测序. 夏润玺,李玉萍,王欢,李喜升,刘彦群,秦利,姜德富,鲁成. 2009

[2]柞蚕微孢子虫全长cDNA文库的构建及EST分析. 王勇,姜义仁,王晓惠,钟亮,黄伶. 2014

[3]资阳香橙根cDNA全长文库的构建及EST分析. 王金萍,宋二玲,姚利晓,李凤龙,何永睿,陈善春. 2011

[4]茶树幼根cDNA文库构建及其表达序列标签特性分析. 赵丽萍,马春雷,陈亮. 2008

[5]兔肝组织cDNA文库的构建及表达序列标签分析. 熊梅,穆亚芳,刘家森,原冬伟,郭东春,姜骞,林欢,曲连东. 2010

[6]沙冬青cDNA文库的构建和EST分析. 郭九峰,孙国琴,沈传进,乔惠蕾,贾利敏,郭志杰. 2007

[7]大菱鲆脾脏cDNA文库构建、EST序列分析与免疫抗病相关基因的筛选. 孟亮,陈松林,刘洋. 2009

[8]新疆雪莲全长cDNA文库构建及表达序列标签(ESTs)特性分析. 王博,艾秀莲,王志方,李芳,罗明. 2008

[9]桑树幼叶cDNA文库的构建及部分表达序列标签分析. 方荣俊,戚金亮,扈冬青,赵卫国,汪伟,张林,刘利,潘刚,沈兴家,潘一乐,杨永华. 2008

[10]‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析. 叶庆亮,江东,彭爱红. 2009

[11]基于表达序列标签(EST)策略的茶树分子生物学研究. 陈亮,赵丽萍,马春雷,张亚丽. 2007

[12]干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析. 曹辉庆,魏源文,邓智年,潘有强,郭元元,何海波,李杨瑞. 2012

[13]茶尺蠖取食胁迫下茶树抑制消减文库的构建. 付建玉,肖强. 2010

[14]山葡萄成熟果皮cDNA文库的构建及ESTs初步分析. 李凤,杨成君,李波,王军,刘海峰. 2010

[15]水滴伪康纤虫全长cDNA文库的构建及EST分析. 林能锋,曾红. 2017

[16]镰形扇头蜱唾液腺抑制消减杂交文库的构建和分析. 向飞宇,周金林,周勇志,龚海燕,沈杰. 2006

[17]胞囊线虫侵染后小粒黑豆抑制消减杂交cDNA文库的构建及EST分析. 王芳,段玉玺,陈立杰,王媛媛,朱晓峰,王东. 2012

[18]从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记. 朱振东,霍云龙,王晓鸣,黄俊斌,武小菲. 2004

[19]大豆干旱和低温cDNA文库的构建与检测. 杨贵春,刘海龙,王世发,刘淑莲,韦正乙. 2009

[20]不同含油量大豆成熟期胚抑制消减cDNA文库构建及其差异表达基因分析. 程金朋,陈波,徐有明,周新安,卢长明,魏文辉. 2007

作者其他论文 更多>>

微信小程序