茶六斑褐锦斑蛾Sorita pulchella线粒体基因组特征与系统发育分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵卓

作者: 赵卓;刘晨阳;瓮青芬;王保海;翟卿

作者机构:

关键词: 茶六斑褐锦斑蛾;线粒体基因组;高通量测序;系统发育关系

期刊名称: 河南农业大学学报

ISSN: 1000-2340

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 277-287

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】了解茶六斑褐锦斑蛾(Sorita pulchella)线粒体基因组特征,探究其分类地位,并分析蛾类高级分类阶元的系统发育关系。【方法】野外采集西藏自治区林芝市易贡茶场发生的茶六斑褐锦斑蛾。采用高通量测序的方法获得线粒体基因组序列并分析其基因组结构特征;用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树,探讨鳞翅目斑蛾科昆虫系统发育关系。【结果】茶六斑褐锦斑蛾(GenBank登录号:MZ157403)线粒体基因组序列的总长度为15 216 bp,编码37个基因,即13个蛋白质编码的基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因(rrnL和rrnS)和1个A+T富含区。其基因组成与其它已知的鳞翅目昆虫一致。蛋白质编码基因的A+T的含量为77.7%,长度为10 830 bp。tRNA中的A+T的含量则为80.9%。22个tRNA的二级结构仅trnS1缺少二氢尿嘧啶环,其它tRNA的二级结构都为典型的三叶草型。20个种进行了系统发育分析,包括两个外群。贝叶斯系统发育树显示斑蛾科内的系统发生关系为:(Zeuzera multistrigata+Endoxyla cinereus)+(((Apoda limacodes+Narosa nigrisigna)+((Iragoides fasciata+(Thosea sinensis+Thosea sythoffi))+(Parasa consocia+(Mahanta tanyae+Monema flavescens))))+((Phauda flammans+Zygaenafilipendulae+((Illiberis pruni+Illiberis ulmivora)+(Pidorus atratus+((Amesia sanguiflua+Rhodopsona rubiginosa)+Eterusia aedea+(Histia rhodope+Sorita pulchella)))))))。最大似然树的结果为:(Endoxyla cinereus+Zeuzera multistrigata+((Apoda limacodes+Narosa nigrisigna)+((Iragoides fasciata+(Thosea sinensis+Thosea sythoffi))+(Parasa consocia+(Mahanta tanyae+Monema flavescens)))+(Zygaena filipendulae+(Phauda flammans+((Illiberis pruni+Illiberis ulmivora)+(Pidorus atratus+((Amesia sanguiflua+Rhodopsona rubiginosa)+(Histia rhodope+(Eterusia aedea+Sorita pulchella)))))))))。【结论】斑蛾科和刺蛾科皆为单系群。贝叶斯系统发育结果表示,六星斑蛾和朱红毛斑蛾分化较早,梨星毛虫与榆斑蛾互为姐妹群,玉带斑蛾单独成为一支,釉锦斑蛾和黑心赤眉锦斑蛾互为姐妹群,茶六斑褐锦斑蛾与重阳木褐锦斑蛾互为姐妹群,它们组成的一支再与茶柄脉锦斑蛾互为姐妹群。

分类号: S435.711

  • 相关文献

[1]藏鸡线粒体基因组特征及系统发育进化. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,马尹鹏,葛庆联,高玉时. 2021

[2]艾氏蛇鳗线粒体基因组全序列结构分析和系统发育关系探讨. 宁子君,刘玉萍,张书飞,高天翔,杨天燕. 2022

[3]芸薹属作物油酸脱饱和酶基因(FAD2)拷贝数和序列变异分析. 李柱刚,马荣才,曹鸣庆,崔崇士. 2004

[4]杧果小条实蝇分子鉴定. 田明,叶军,刘娣,易建平,周国梁,郑建中. 2008

[5]基于5S rDNA序列利用ARMS技术鉴定蜘蛛香(英文). 刁英,段卫涛,林先民,廖朝林,胡中立. 2010

[6]基于叶绿体DNA序列trnL-F分析李亚属植物的系统发育关系. 章秋平,魏潇,刘威生,董文轩,刘宁,张玉萍,徐铭,刘硕,张玉君,马小雪. 2017

[7]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

[8]文昌鸡线粒体控制区遗传多态性及系统进化分析. 章明,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,高玉时. 2016

[9]德化黑鸡线粒体DNA控制区全序列测定及起源研究. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,顾荣,葛庆联,高玉时. 2015

[10]基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系. 高玉时,贾晓旭,唐修君,唐梦君,樊艳凤,陆俊贤,顾荣,葛庆联,苏一军. 2015

[11]云龙矮脚鸡系统进化及遗传多样性的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

[12]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

[13]基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析. 黄胜海,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,葛庆联,高玉时. 2018

[14]边鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2018

[15]番茄Hsp70基因鉴定及系统发育关系分析. 王荣青,万红建,李志邈,叶青静,阮美颖,周国治,姚祝平,杨悦俭. 2014

[16]寿光鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2019

[17]黄鳝P-450芳香化酶基因的克隆及序列分析. 俞菊华,吴婷婷,李建林,曹丽萍,夏德全. 2005

[18]石岐鸽mtDNA Cytb基因遗传多样性分析. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,叶俊文,樊艳凤,马尹鹏,李正晟,许小飞,高玉时. 2023

[19]三倍体茶树'西莲1号'叶绿体基因组特征及系统发育分析. 刘振,赵洋,杨培迪,成杨,唐怀廷,杨阳. 2023

[20]基于Cytb基因的东印度洋鸢乌贼系统发育关系和种群遗传结构. 许莎莎,唐峰华,任慧敏,李治洪,何利军. 2021

作者其他论文 更多>>