紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、 进化及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 齐晓

作者： 齐晓;张正社;闵学阳;孙启忠;刘文献

作者机构：

关键词： bZIP转录因子;紫花苜蓿;系统进化分析;密码子偏好性

期刊名称： 草业科学

ISSN： 1001-0629

年卷期： 2017 年 08 期

页码： 1635-1648

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性。该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基。此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类。相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01)。本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础。

分类号： S541.9

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