FMDV Asia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张中旺

作者： 张中旺;张永光;王永录;潘丽;方玉珍;刘力宽;蒋守田;吕建亮;周鹏;张昱;张淑刚;杜进鑫;李正丰

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;结构蛋白;测序;B细胞表位

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2009 年 24 卷 04 期

页码： 61-67

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对口蹄疫病毒Asia1/HeB株P1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定。采用DNAStar Protean软件对P1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布。结果表明,FMDV Asia I/HeB株P1基因长2199 bp,包含完整的开放阅读框,编码733个氨基酸,其中VP1长633 bp,编码211个氨基酸,VP2长654 bp,编码218个氨基酸,VP3长657 bp,编码219个氨基酸,VP4长255 bp,编码85个氨基酸。P1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞优势表位,VP4上也有少量的潜在B细胞表位。与已鉴定的B细胞表位相比较,该方法预测的结果有较高的准确度。为试验确定FMDV AsiaI/HeB株P1结构蛋白的B细胞表位和反向疫苗学设计提供了理论基础。

分类号： S852.65

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