转录组及代谢组联合解析胡麻根部对盐胁迫的响应机制
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵玮
作者: 赵玮;赵利;张建平;齐燕妮;王利民;谢亚萍;李闻娟;党照;袁明璐;张艳萍
作者机构:
关键词: 胡麻;根部;转录组;代谢组;联合分析;盐胁迫;响应机制
期刊名称: 草业科学
ISSN: 1001-0629
年卷期: 2022 年 39 卷 006 期
页码: 1151-1164
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 通过"广靶代谢组?+?转录组"联合分析方法,对NaCl胁迫下胡麻(Linure usitatissmum)耐盐种质资源R40和敏感资源R24根部差异表达基因与差异积累代谢物进行共表达分析,以探明代谢物与关键基因的协同变化情况,阐明胡麻的耐盐代谢过程和变化规律,发掘胡麻中可能调控抗盐代谢途径的重要基因.共鉴定出具有显著差异的代谢物741个,其中下调409个,上调332个,鉴定出差异表达基因30233条,其中上调15827条,下调14406条,有注释结果的转录因子13015个.富集前十的代谢物几乎都有相对应的功能转录因子富集,如黄酮和黄酮醇的生物合成、苯丙素的生物合成、氨基糖和核苷酸糖的代谢、花青素生物合成、类黄酮生物合成等通路均有对应的转录因子参与其中.胡麻根部在盐胁迫下调控抗盐代谢途径的重要基因主要以参与调控糖类代谢为主,增强细胞的渗透压,从而有效降低盐碱胁迫的伤害;筛选出的8个候选基因与5个代谢物具有明显的相关性,每一个代谢物与一个或多个基因相关联,色氨酸–生长素通路发现,GH3基因是一种典型的与植物生长素原初反应相关的基因,在植物的抗逆防卫反应中起重要作用.
分类号:
- 相关文献
[1]代谢组和转录组联合解析马蔺花瓣花青素积累机制. 李楠,毛培春,郑明利,云岚,田小霞,孟林. 2025
[2]矮腥黑粉菌胁迫的小麦全基因组重测序与转录组联合分析. 沈潼,肖越,粟神强,贾玉凤,郭巧玲,刘琦,肖永贵. 2024
[3]miRNA-mRNA联合分析研究抑制miR-99b-3p对山羊骨骼肌卫星细胞的影响机制. 林月霞,吕玉华,朱丽慧,戴建军,张德福,廖荣荣. 2024
[4]'红太阳'墨兰不同叶色时期的转录组和代谢组联合分析. 高洁,相楚嫣,赵俊宏,潘启明,杨凤玺. 2024
[5]适用于转录组测序的棉花幼根总RNA提取方法筛选. 王春晖,赵云雷,王红梅,陈伟,龚海燕,桑晓慧. 2013
[6]林木盐胁迫响应机制研究进展. 赵宝泉,邢锦城,温祝桂,徐海东,王进左,李玉明,董静,洪立洲. 2020
[7]棉花对盐胁迫的响应机制及缓解措施的研究进展. 刘祎,崔淑芳,张海娜,钱玉源,王广恩,金卫平,李俊兰. 2015
[8]基于转录组和代谢组分析马齿苋根茎叶中类黄酮代谢. 张少平,邱珊莲,黄惠明,张帅,林宝妹,洪佳敏,郑开斌. 2021
[9]遮阴对柠檬香茅类黄酮及其合成酶基因差异表达研究. 张少平,鞠玉栋,李洲,练冬梅,吴松海,赖正锋,洪建基. 2023
[10]NaCl胁迫下哈茨木霉ACCC32524的转录组和代谢组分析. 向杰,陈敬师,夏鑫鑫,刘快,李世贵,顾金刚. 2019
[11]遮阴对柠檬香茅中萜类化合物及其合成酶基因影响研究. 张少平,邱珊莲,黄惠明,李海明,李洲,鞠玉栋,郑开斌. 2023
[12]银川羊角椒雄性不育两用系转录组与代谢组关联分析. 颜秀娟,何鑫,赵云霞,高晶霞,王学梅. 2021
[13]基于转录组和代谢组解析香瓜茄果实类黄酮代谢差异. 司诚,杨世鹏,孙祝,张广楠,钟启文. 2023
[14]叶面喷施丹参碳点缓解甘薯低磷胁迫的转录组与代谢组学分析. 朱晓亚,张强强,赵鹏,刘明,王静,靳容,于永超,唐忠厚. 2024
[15]草地贪夜蛾甲维盐敏感度下降品系与敏感品系的转录组和代谢组比较分析. 苏湘宁,李传瑛,黄少华,廖章轩,刘伟玲,章玉苹. 2023
[16]紫叶甘蓝型油菜花青素合成的转录组-代谢组联合分析. 周弘峰,朱思颖,贺丹,刘丽莉,陈道宗,谭晨,张大为,严明理. 2024
[17]黄芪多糖在草菇冷藏保鲜中的应用. 郑婷婷,黄天宇,龚明,王瑞娟,吴莹莹,万佳宁,汪滢. 2023
[18]转录组和代谢组在林木真菌病害防御反应中的应用研究进展. 邓薪岐,王谢,严晓军,柯佳君,杨叶,李艳,徐丹萍,卓志航,严贤春. 2022
[19]转录组和代谢组分析瘤菌根菌对铁皮石斛的促生机制. 王伟英,林江波,邹晖,戴艺民. 2023
[20]基于转录-代谢联合分析哈茨木霉ACCC32527对NaCl胁迫的分子调节. 向杰,陈敬师,夏鑫鑫,刘快,李世贵,顾金刚. 2019
作者其他论文 更多>>
-
基于BSA-Seq定位胡麻耐盐相关基因位点
作者:张艳萍;叶春雷;齐燕妮;陈军;赵玮;柴宗文
关键词:胡麻;BSA-Seq;抗盐基因
-
单倍体育种研究进展及其在亚麻育种中的应用
作者:齐燕妮;王利民;李闻娟;党照;汪平;赵玮;谢亚萍;徐晨梦;王琰;张建平
关键词:双单倍体育种;活体单倍体;DMP;PLA1;亚麻
-
糖分子聚合度和种类对低酯酰胺果胶凝胶性能的影响
作者:赵玮;毕金峰;马有川;易建勇
关键词:低酯酰胺果胶;聚合度;糖;凝胶;质构
-
硒肥促进作物提质增产机理研究进展
作者:谢亚萍;袁明璐;任亮;赵宝勰;张建平;王利民;李闻娟;赵玮;党照;周阳晨;王兴珍;齐燕妮;安明远
关键词:硒肥;提质;增产;生物胁迫;非生物胁迫
-
芍药根茎形成发育过程中内源激素和碳水化合物的变化
作者:王慧娟;王二强;符真珠;李艳敏;王晓晖;袁欣;高杰;王利民;张和臣
关键词:芍药;根茎;内源激素;碳水化合物
-
基因Ⅳ型禽呼肠孤病毒σC蛋白单克隆抗体的制备及功能鉴定
作者:高金慧;王素艳;刘芮;祁小乐;陈运通;张艳萍;崔红玉;刘永振;段雨路;高立;高玉龙
关键词:禽呼肠孤病毒;基因Ⅳ型;σC蛋白;单克隆抗体;功能鉴定
-
鸡群中鸡传染性贫血病原与抗体检测及分离株VP1基因序列分析
作者:冯笑艳;胡明雪;林雨萌;刘长军;李凯;祁小乐;崔红玉;高立;王素艳;陈运通;王笑梅;张艳萍;高玉龙
关键词:鸡传染性贫血病毒;血清学检测;病原学检测;病毒分离鉴定;VP1基因序列分析