应用系统进化方法评估徐海鸡遗传资源

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭军

作者： 郭军;曲亮;窦套存;王星果;胡玉萍;马猛;韩威;束婧婷;王克华

作者机构：

关键词： 地方鸡;遗传多样性;GBS测序;Mantel测试;系统进化树

期刊名称： 中国家禽

ISSN： 1004-6364

年卷期： 2021 年 43 卷 001 期

页码： 18-23

收录情况： 北大核心

摘要： 利用简化基因组SNPs数据分析徐海鸡及周边地方鸡种遗传多样性,为徐海鸡的保护和利用提供支持.收集徐海鸡等13个地方鸡种血液样品,提取基因组DNA,应用简化基因组测序技术进行SNP分型,获取群体遗传学参数,并以邻接法、最大似然法、贝叶斯法构建系统进化树.结果显示:徐海鸡基因组SNPs观测杂合度为0.18,期望杂合度为0.28,在受试地方鸡种中品种内遗传多样性属于中等程度.Mantel测试表明遗传距离与地理距离呈现正相关(P<0.05).系统进化树显示多数地方鸡种间存在明显界限.研究表明:徐海鸡独立成枝,与其它地方鸡种存在遗传上差别;地方鸡种之间存在有限的基因流;与最大似然法、贝叶斯法相比,邻接法更适合利用简化基因组数据构建系统进化树.

分类号： S831.2

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