绵羊肺炎支原体GH3-3株全基因组测序及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田彤彤

作者： 田彤彤;葛家振;高鹏程;李学瑞;宋国栋;郑福英;储岳峰

作者机构：

关键词： 绵羊肺炎支原体;GH3-3株;全基因组测序;毒力因子;耐药基因

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2024 年 007 期

页码： 323-334

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】全面了解绵羊肺炎支原体GH3-3株的基因序列，研究其潜在的致病机制及其复制、转录、翻译过程的调控机制。【方法】采用体外培养，利用细菌基因组DNA提取试剂盒提取绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组DNA，进行全基因组测序。【结果】绵羊肺炎支原体GH3-3株基因组大小为1 060 772 bp，GC含量为29.66%，基因组组分分析后发现，GH3-3株的基因组含有730个编码基因，总长度为914 379 bp，平均长度为1 252.57 bp，占基因组全长的86.2%。串联重复序列共149个，总长为20 926 bp，占基因组全长的1.97%。微卫星DNA序列102个，tRNA 30个，rRNA 3个。在NR、SwissProt、GOG、KEGG、GO、CARD、CAZy、PHI、TCDB、RMS数据库中，分别有719、459、473、394、449、33、5、180、113、59个基因被注释；在VFDB数据库中，共注释到了76个毒力因子相关的基因。将基因组序列提交至NCBI网站，获得登录号为：PRJNA1051969。【结论】获得了绵羊肺炎支原体GH3-3株完整的基因组信息，预测和注释了其基因的功能，明确了GH3-3株以及与国内外其他绵羊肺炎支原体菌株之间的遗传进化关系。

分类号： S858.26

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