基于mtDNA D-loop区全序列的琅琊鸡遗传多样性和系统进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 唐修君

作者： 唐修君;贾晓旭;樊艳凤;高玉时;葛庆联;顾荣;陆俊贤;刘茵茵;王珏

作者机构：

关键词： 琅琊鸡;mtDNA;D-loop区;遗传多样性;系统进化

期刊名称： 扬州大学学报(农业与生命科学版)

ISSN： 1671-4652

年卷期： 2017 年 02 期

页码： 47-51

收录情况： 北大核心

摘要： 为探讨琅琊鸡遗传多样性和系统进化,了解琅琊鸡母系起源,以30只琅琊鸡为素材,通过PCR扩增和测序技术,对mtDNA D-loop区全序列进行测序,并与GenBank中公布的D-loop区全序列的19条红色原鸡序列进行比对和分析。结果表明:琅琊鸡mtDNA D-loop区全长为1 231~1 232bp,1 231bp的个体在859bp处存在C碱基缺失;30只个体共发现25处单核苷酸多态位点,为13种单倍型,核苷酸多样度(Pi)为0.006 47±0.005 13,单倍型多样度(Hd)为0.887±0.038,平均核苷酸差异(K)为7.968;系统发育分析显示,琅琊鸡具有多个母系起源,13种单倍型可分为A、B、C和E 4个分支,其中E分支为琅琊鸡的优势单倍型,与原鸡印度亚种(Gallus gallus murghi)聚为一类。这一研究从分子水平为琅琊鸡遗传资源保护和开发利用提供了参考。

分类号： S831.2

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