猪繁殖与呼吸综合征病毒流行株Jiangxi-3的全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王旭荣

作者： 王旭荣;张彩勤;赵炳武;张春红;杨增岐;宋长绪

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;Jiangxi-3;全基因组;序列分析

期刊名称： 上海交通大学学报(农业科学版)

ISSN： 1671-9964

年卷期： 2009 年 27 卷 02 期

页码： 101-107

摘要： 通过RT-PCR分段扩增PRRSV流行株Jiangxi-3的基因组,参照VR2332序列,根据各片段之间相重叠的区域,将扩增片段的序列依次拼接获得Jiangxi-3完整的全基因组,并通过DNAStar软件对其进行分析。结果表明:Jiangxi-3的Nsp2推导氨基酸发生30个氨基酸的不连续缺失,与HB-1(sh)/2002相比,Nsp2推导的第480位氨基酸由D突变为E,缺失的位置为第481位氨基酸和532～560位氨基酸;Jiangxi-3与2006年Tian Kegong等从江西"高热病"病死猪体内分离的毒株JXA1的各个结构蛋白阅读框的氨基酸同源性为98.0%～100%;Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002、VR2332、RespPRRSMLV的Nsp2推导的氨基酸同源性分别为94.7%、77.8%、77.7%,由遗传系统发育树可知与2006年以前分离的毒株相比,Jiangxi-3与HB-1(sh)/2002的亲缘关系较近。说明Jiangxi-3和JXA1极可能由同一毒株HB-1(sh)/2002演化而来。

分类号： S852.651

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