2株猪繁殖与呼吸综合征病毒海南株的ORF5基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马佳镁

作者： 马佳镁;钟植文;范悦轩;黄春媛;郑佳馨;曹芳芳;王金泉;刘光亮;曹宗喜

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5 基因;多重序列比对;同源性

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2023 年 60 卷 012 期

页码： 3049-3056

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]鉴定我国海南省新发现的 2 株猪繁殖与呼吸综合征病毒株HNHK1-2021 和HNLG1-2021的进化关系.[方法]采用PCR方法对ORF5 基因进行扩增和序列测定,利用MegAlign软件进行多重序列比对,利用MEGA X软件邻接法构建进化树.[结果]PRRSV HNHK1-2021 和HNLG1-2021 毒株核苷酸相似性为82.9%,推导氨基酸相似性为 82.6%.HNHK1-2021 毒株和NADC30 类 PRRSV、QYYZ类 PRRSV、VR-2332 类 PRRSV 以及 JXA1 类 PRRSV 序列比对,80.8%~82.8%、90.2%~92.0%、82.1%~83.4%、81.9%~84.4%,推导氨基酸相似性分别为 82.1%~84.6%、91.5%~94.5%、80.1%~83.1%、82.6%~84.6%;HNLG1-2021 毒株和 NADC30 类 PRRSV、QYYZ 类 PRRSV、VR2332 类 PRRSV 以及 JXA1 类PRRSV序列比对,核苷酸相似性分别为 83.7%~84.6%、81.8%~83.6%、97.7%~99.5%、85.6%~90.4%,推导氨基酸相似性为83.6%~85.1%、81.1%~82.6%、96.0%~98.5%,86.1%~90.5%.[结论]2 株病毒株均属于北美型PRRSV,HNHK1-2021 毒株属于QYYZ类PRRSV(谱系 3).HNLG1-2021 毒株属于VR-2332 类PRRSV(谱系5).

分类号： S855.2

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