草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 汪虹
作者: 汪虹;陈明杰;冯爱萍;谭琦;鲍大鹏
作者机构:
关键词: 草菇;A交配型基因;同源异形结构域蛋白
期刊名称: 食用菌学报
ISSN: 1005-9873
年卷期: 2015 年 22 卷 01 期
页码: 1-7
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,长度分别为1341bp和1450bp,各编码446和429个氨基酸残基;A2位点的交配型基因为HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,长度分别为1442bp和1501bp,各编码463和443个氨基酸残基。利用生物信息学方法分析了泰国1号及另外两株草菇代表性菌株V23和屏优的交配型基因编码的HD蛋白序列,结果表明:HD蛋白均含有同源异形结构域。根据系统进化树可以看出,泰国1号与V23、屏优菌株A位点HD1和HD2基因序列所编码的氨基酸序列之间亲缘关系复杂,可能具有不同的起源。
分类号: S646.13
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