基于转录组测序的紫色秋葵花青素合成相关基因研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张少平

作者： 张少平;应璐;邱珊莲;张帅;洪建基;郑开斌;余文权

作者机构：

关键词： 紫色秋葵;花青素基因;转录组;测序分析;功能注释

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 474-480

收录情况： 北大核心

摘要： 紫色秋葵富含花青素,因此其全株及果实均为紫红色,为获取正常生长状态下紫色秋葵花青素合成代谢相关基因,采用Illumina HiSeq 2500高通量转录组测序技术对紫色秋葵全转录功能基因组测序后组装,再通过Nr、SwissProt和GO等三大数据库进行花青素相关功能基因筛选。三大数据库涉及35个花青素相关Unigene,具体包括19个花青素相关糖基转移酶、6个花青素酰基转移酶家族基因,5个无色花色素双加氧酶(合酶)以及5个花色素相关还原酶。这些花青素相关基因在Nr及SwissProt数据库中涉及较多相关植物,包括拟南芥、可可、树棉、木薯、苹果及葡萄等。聚类分析研究表明:涉及花青素相关四大家族成员的35个Unigene中,无色花色素双加氧酶亲缘关系最近,花青素酰基转移酶次之,花青素相关还原酶亲缘关系稍远,而花青素相关糖基转移酶家族成员亲缘关系最远。本研究获取的紫色秋葵众多花青素相关转移酶、合酶及还原酶等相关Unigene,为进一步研究紫色秋葵或其他植物的花青素合成代谢过程中基因克隆分析等奠定了坚实基础。

分类号： S649

  • 相关文献

[1]基于转录组测序的紫背天葵花青素相关基因分析. 张少平,张少华,邱珊莲,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌,郑加协. 2018

[2]基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析. 夏丽飞,孙云南,宋维希,朱兴正,田易萍,蒋会兵,陈林波. 2020

[3]紫色黄秋葵转录组功能基因测序及分析. 张少平,邱珊莲,郑云云,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌. 2017

[4]基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究. 张雅玲,王小安,潘少霖,叶新福. 2017

[5]青梗花椰菜和白梗花椰菜转录组分析. 林珲,薛珠政,李永平,李大忠,刘建汀,朱海生,温庆放. 2018

[6]溪黄草转录组测序及生物信息学分析. 王继华,蔡时可,梅瑜,李汉章,杨少海. 2020

[7]8个番石榴品种的转录组测序. 张丽梅,陈钟佃,张朝坤,魏秀清,许家辉. 2021

[8]基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2019

[9]张溪香芋转录组测序及生物信息学分析. 王继华,罗群胜,梅瑜,杨少海. 2020

[10]芒果果实转录组数据组装及基因功能注释. 武红霞,许文天,罗纯,姚全胜,王松标,马小卫,詹儒林. 2016

[11]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022

[12]黄秋葵花和果荚转录组测序及类黄酮代谢差异表达分析. 姚运法,张少平,练冬梅,赖正锋,黄慧明,洪建基. 2018

[13]金毛狗转录组测序及生物信息学分析. 蔡时可,梅瑜,陈炜玲,史广生,李静宇,王继华. 2022

[14]紫背天葵高通量转录组测序分析. 张少平,洪建基,邱珊莲,郑云云,张帅,吴松海,何炎森,郑开斌,郑加协. 2016

[15]鸟巢蕨转录组高通量测序及分析. 贾新平,孙晓波,邓衍明,梁丽建,叶晓青. 2014

[16]显齿蛇葡萄转录组测序、注释与分析. 徐友阳,王德勤,李静宇,梅瑜,王继华,蔡时可. 2022

[17]基于高通量测序的建兰转录组信息分析. 樊荣辉,林兵,吴建设,钟淮钦. 2023

[18]椰子织蛾转录组分析. 徐志文,任雪敏,王俊,张枝全,刘乃勇,阎伟,朱家颖. 2018

[19]独脚金转录组特征分析. 张龙,蔡时可,孙金锴,梅瑜,王继华. 2023

[20]松萝凤梨转录组测序分析. 金亮,田丹青,詹书侠,安霞,葛亚英,王炜勇. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序