虾夷扇贝脂多糖诱导的肿瘤坏死因子LITAF基因的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赫崇波

作者： 赫崇波;朱宝;刘卫东;鲍相渤;李云峰;单忠国;李宏俊

作者机构：

关键词： 虾夷扇贝;脂多糖诱导的肿瘤坏死因子;序列分析;胚胎发育;基因表达

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2012 年 34 卷 06 期

页码： 736-741

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 脂多糖诱导的肿瘤坏死因子(Lipopolysaccharide-induced TNF-alpha factor,LITAF)是一类重要的炎症细胞因子,在先天性免疫系统中发挥重要的介质作用。文章根据虾夷扇贝LITAF基因EST序列,应用RACE技术克隆了虾夷扇贝LITAF全长cDNA,对序列及编码的氨基酸进行生物信息学分析。结果显示,该基因cDNA全长1 551 bp,其5′非编码区包含76 bp,3′非编码区包含1 001 bp;开放阅读框(ORF)为474 bp,编码157个氨基酸,氨基酸序列中存在一个保守的LITAF结构域;理论分子量16.99 kDa,等电点为6.24。LITAF基因序列为3 698 bp,由3个外显子和两个内含子组成。利用实时荧光定量PCR技术分析LITAF在虾夷扇贝不同组织、不同胚胎发育阶段以及鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激后各时间段的表达情况。结果表明:LITAF基因在所检测的6个成体组织中均有表达,其中肾脏的表达量最高;胚胎发育的7个时期中,担轮幼体时期表达量最高;菌刺激36 h实验组与对照组的表达量差异大。LITAF基因是LITAF家族的一员,推测LITAF基因参与虾夷扇贝的先天性免疫反应。

分类号： S917.4

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