贵州黔西南烟草中辣椒脉斑驳病毒的鉴定及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈越

作者： 陈越;朱迪;李婷婷;钟静;高贵;穆青;曹毅;丁铭

作者机构：

关键词： 烟草;辣椒脉斑驳病毒;遗传多样性;CP基因

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2023 年 53 卷 006 期

页码： 1072-1082

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为明确贵州黔西南烟草中辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)的遗传多样性和分子进化特征,本研究以2021-2022年采集自贵州省黔西南州兴义市的52份疑似感染ChiVMV的烟草样品为实验材料,利用马铃薯Y病毒属(Potyvirus)通用引物和ChiVMV特异性引物进行RT-PCR检测、克隆和测序,并结合GenBank中已公布的相关序列对分离获得的16个ChiVMV贵州烟草分离物进行基于外壳蛋白(coat protein,CP)CP基因的遗传多样性和分子进化分析.结果显示,所获得的ChiVMV贵州烟草分离物与GenBank中其他36个分离物CP基因的核苷酸一致性为84.79%~99.65%;基于ChiVMV CP基因的系统进化分析发现,52个不同来源的ChiVMV分离物在进化上可以聚为3个不同的分支,聚类结果具有明显的地理分布特征;遗传多样性和进化分析结果表明,各群体受到地理分布的影响而表现出较高的遗传多样性,各群体间的遗传分化显著且基因交流频率较低.研究结果为ChiVMV抗病品种的选育和该类病毒病的防治具有重要意义.

分类号： S432.1

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