苏紫猪SLA-1基因多态性及其抗病潜能分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王泽平

作者： 王泽平;王飞飞;张芮铭;付言峰;赵为民;戴超辉;程金花;廖超;李辉

作者机构： 宿迁市农业科学研究院;江苏省农业科学院畜牧研究所

关键词： 苏紫猪;SLA-1基因;多态性;抗原结合位点;抗病潜能

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1918-1927

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探究苏紫猪白细胞抗原-1（swine leukocyte antigen-1,SLA-1）基因多态性，并对其抗病潜能进行分析，以期为苏紫猪分子育种提供理论基础。【方法】以苏紫猪血细胞cDNA为模板，用PCR法扩增苏紫猪SLA-1基因并测序，利用DNAStar和Mega 5.0软件分别进行相似性分析及系统进化树构建；利用NetMHCpan 4.1 server分析SLA-1与非洲猪瘟病毒（African swine fever virus, ASFV）抗原表位结合的能力及特征；运用生物学软件对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、结构和功能等进行预测。【结果】试验成功扩增6条苏紫猪SLA-1等位基因序列，分别为SLA-1*sz01、SLA-1*sz02、SLA-1*sz03、SLA-1*sz04、SLA-1*sz05和SLA-1*sz06,其高变异位点主要位于肽结合沟（peptide-binding groove, PBG）α1区和α2区；相似性比对结果显示，6条苏紫猪SLA-1等位基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.9%～96.9%、87.0%～94.8%之间，与不同品种猪核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.8%～98.8%、84.3%～98.0%之间；ASFV来源多肽结合能力的预测结果显示，SLA-1*sz01蛋白具有较强的ASFV抗原呈递能力，与ASFV来源B354L蛋白多肽片段FIDKTTVLY具有最高亲和力；SLA-1*sz01蛋白功能域及三级结构预测结果显示，SLA-1*sz01与免疫系统相关，具有经典的SLA-1三级结构。【结论】本研究扩增得到6条苏紫猪SLA-1基因序列，其中SLA-1*sz01能够限制性结合较多的ASFV来源抗原表位多肽，与多肽片段FIDKTTVLY具有最高亲和力，可作为苏紫猪抗病育种的候选基因。研究结果为ASFV疫苗的研发提供参考基础。

分类号： S828

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