利玛原甲藻PL11共附生菌多样性研究

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李月月

作者: 李月月;田晓清;韩清华;樊成奇;马丽艳;陆亚男

作者机构:

关键词: 利玛原甲藻;腹泻性贝毒;共附生菌;高通量测序

期刊名称: 海洋渔业

ISSN: 1004-2490

年卷期: 2020 年 01 期

页码: 73-81

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为揭示产腹泻性贝类毒素(diarrheic shellfish poisoning, DSP)典型赤潮甲藻-利玛原甲藻(Prorocentrum lima)PL11的共附生菌群多样性信息,通过Illumina MiSeq高通量测序分析了PL11的共附生菌群种类及相对丰度,并且对其可培养共附生菌株进行了选择性分离及其16S rRNA基因序列扩增与系统发育的分析。利玛原甲藻PL11高通量测序结果显示:样品共附生细菌包括5门,14纲,26目,38科及54属。其中优势门(>5%)为3个,包括变形菌门(Proteobacteria,75.5%)、拟杆菌门(Bacteriodetes,11.5%)以及浮霉菌门(Planctomycetex,8.5%);优势纲(>5%)为4个,包括α-变形菌纲(Alphaproteobacteria,51.7%)、δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria,31.8%)、鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria,9.9%)以及OM190纲(8.9%);优势属(>5%)为6个,侏囊菌科下未知属(norank Nannocystaceae,21.8%)、Pyruvatibacte属(11.6%)、Phaeodactylibacter属(9.4%)、生丝单胞菌科下未知属(norank Hyphomonadaceae,8.5%)、OM190纲下未知属(8.1%)以及Roseovarius属(7.9%)。从利玛原甲藻PL11培养物中分离获得可培养微生物菌株9株,分属于8个属,包括Ochrobactrum sp.(2株)及Microbacterium sp.、Algoriphagus sp.、Ponticoccus sp.、Hoeflea sp.、Labrenzia sp.、Sphingopyxis sp.、Erythrobacter sp.各1株。其中PL11-1为Ponticoccus属潜在新种。

分类号: X17

  • 相关文献

[1]利玛原甲藻产毒差异及影响因素研究进展. 张昊宇,吴海燕,董晨帆,郑关超,郭萌萌,谭志军. 2023

[2]东海产麻痹性贝毒链状亚历山大藻共附生菌群多样性研究. 唐莹莹,乔玉宝,蒋志伟,张静,张若男,田晓清,马丽艳,张晓玲,陆亚男,樊成奇,杨桥. 2018

[3]高效液相色谱-离子阱质谱法测定海洋微藻藻粉中的8种脂溶性毒素. 高莉媛,王艳龙,陈军辉,王帅,史小星,石洪华,郑立. 2016

[4]珠江口与大亚湾海域腹泻性贝毒污染状况分析. 李嘉雯,江涛,吴锋,江天久. 2014

[5]温度和氮、磷限制对南海一株利玛原甲藻生长和产毒的影响. 仲云,吴海燕,江涛,郑关超,吕颂辉,谭志军. 2021

[6]13C示踪技术在利玛原甲藻中腹泻性贝毒合成研究的应用. 张昊宇,谭志军,郑关超,吕颂辉,杨越聪,吴海燕. 2023

[7]耐受高浓度糖蜜酒精废液的细菌群落的多样性分析. 汤宏赤,郭媛,樊少林,庞浩. 2019

[8]去势对淮南猪皮下脂肪PPAR信号通路基因表达量的影响. 王璟,白献晓,张家庆,高彬文,陈俊峰,高原,任巧玲,马强,郭红霞,梁永红,邢宝松. 2016

[9]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017

[10]大菱鲆仔稚鱼发育早期肠道菌群结构形成的影响因素. 史秀清,王印庚,张正,廖梅杰,李彬,张述智,李华. 2015

[11]基于Mi-Seq高通量测序分析裸体异鳔鳅鮀微卫星组成. 曾晓芸,杨宗英,田辉伍,汪登强. 2015

[12]基于新一代测序技术的昆虫转录组学研究进展. 张棋麟,袁明龙. 2013

[13]豆科作物间作燕麦对土壤固氮微生物丰度和群落结构的影响. 杨亚东,冯晓敏,胡跃高,任长忠,曾昭海. 2017

[14]新疆泥火山微生物群落. 覃千山,承磊,张辉,胡国全. 2015

[15]高通量基因组测序在农作物基因定位与发掘中的应用. 刘毅,余新桥,张安宁,王飞名,刘国兰. 2016

[16]假眼小绿叶蝉微卫星位点的生物信息学分析. 李倩,陈学新,韩宝瑜. 2016

[17]脑缺血再灌注损伤后小分子RNA的分析. 高蕊,甘尚权. 2011

[18]基于高通量测序的青石斑鱼基因组微卫星开发及评价. 高峰涛,邵长伟,崔忠凯,王升鹏,魏敏,陈松林,杨官品. 2017

[19]基于高通量测序的丁酸梭菌对肉鸡盲肠菌群结构的影响. 肖英平,杨彩梅,代兵,李开锋,陈镜刚,杨华. 2017

[20]胜利油田油泥沙细菌和古菌多样性研究. 方绍燕,张辉. 2014

作者其他论文 更多>>