腐皮镰刀菌侵染甘薯的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗勤川

作者： 罗勤川;唐伟;马居奎;陈晶伟;杨冬静;高方园;孙厚俊;谢逸萍;张成玲

作者机构：

关键词： 腐皮镰刀菌;甘薯;转录组

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1097-1107

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 腐皮镰刀菌（Fusarium solani）是甘薯上的重要病原菌，易引起甘薯根腐病、腐烂溃疡病等。为明确F.solani在侵染甘薯时病原基因变化趋势，对腐烂溃疡病病菌侵染甘薯不同时期取样，通过Illumina Hiseq 4000高通量测序平台测定及分析序列。结果表明，共获得1 068 861 644条有效数据，F.solani侵染后6 h、24 h、3 d、5 d分别筛选出了1 056、995、737、935个显著差异表达基因，其中上调基因分别有587、679、430、551个，下调基因分别有469、316、307、384个，GO功能分析差异基因富集在分子功能和细胞组分，KEGG通路富集分析属于代谢和遗传信息过程。其中差异表达倍数2倍以上，且表达量水平前20的差异基因，有15个基因参与碳水化合物、能量、核苷酸以及氨基酸代谢；3个基因参与翻译和蛋白质加工和修饰等遗传信息处理；2个基因参与细胞自噬过程。随机筛选9个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证，结果表明，这9个基因的表达模式与转录组数据分析结果基本一致。本研究结果发现，F.solani在侵染甘薯过程中代谢活跃，这可能是其在侵染甘薯过程中需破除寄主防御并在寄主中定殖，需要自身和寄主提供大量的营养物质并转化为能量以及中间产物等物质所致。

分类号： S435.313

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