腐皮镰刀菌侵染甘薯的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗勤川

作者： 罗勤川;唐伟;马居奎;陈晶伟;杨冬静;高方园;孙厚俊;谢逸萍;张成玲

作者机构：

关键词： 腐皮镰刀菌;甘薯;转录组

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 1097-1107

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 腐皮镰刀菌（Fusarium solani）是甘薯上的重要病原菌，易引起甘薯根腐病、腐烂溃疡病等。为明确F.solani在侵染甘薯时病原基因变化趋势，对腐烂溃疡病病菌侵染甘薯不同时期取样，通过Illumina Hiseq 4000高通量测序平台测定及分析序列。结果表明，共获得1 068 861 644条有效数据，F.solani侵染后6 h、24 h、3 d、5 d分别筛选出了1 056、995、737、935个显著差异表达基因，其中上调基因分别有587、679、430、551个，下调基因分别有469、316、307、384个，GO功能分析差异基因富集在分子功能和细胞组分，KEGG通路富集分析属于代谢和遗传信息过程。其中差异表达倍数2倍以上，且表达量水平前20的差异基因，有15个基因参与碳水化合物、能量、核苷酸以及氨基酸代谢；3个基因参与翻译和蛋白质加工和修饰等遗传信息处理；2个基因参与细胞自噬过程。随机筛选9个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证，结果表明，这9个基因的表达模式与转录组数据分析结果基本一致。本研究结果发现，F.solani在侵染甘薯过程中代谢活跃，这可能是其在侵染甘薯过程中需破除寄主防御并在寄主中定殖，需要自身和寄主提供大量的营养物质并转化为能量以及中间产物等物质所致。

分类号： S435.313

  • 相关文献

[1]叶面喷施丹参碳点缓解甘薯低磷胁迫的转录组与代谢组学分析. 朱晓亚,张强强,赵鹏,刘明,王静,靳容,于永超,唐忠厚. 2024

[2]基于转录组测序数据的甘薯SSR标记开发及群体聚类分析. 杨育峰,史典义,王雁楠,杨国红,徐心志,翟红,何绍贞,刘庆昌,苏文瑾. 2018

[3]转录组与代谢组联合分析揭示遮阴胁迫下甘薯的代谢响应途径. 王雁楠,陈金金,卞倩倩,胡琳琳,张莉,尹雨萌,乔守晨,曹郭郑,康志河,赵国瑞,杨国红,杨育峰. 2023

[4]甘薯响应冷胁迫的转录组分析. 周桦楠,潘家荃,刘冠求,万博,王凯,于涛. 2022

[5]甘薯储藏期低温胁迫的转录组分析和关键基因挖掘. 肖世卓,张毅,戴习彬,周志林,孙健,曹清河. 2024

[6]甘薯茎基部腐烂病调查及病原鉴定. 黄立飞,刘伟明,刘也楠,何贤彪. 2019

[7]不同培养基对甘薯干腐病菌产孢的影响. 杨冬静,孙厚俊,张成玲,徐振,谢逸萍. 2017

[8]魔芋茎腐病病原的生物学特性及不同杀菌剂对病原菌的室内毒力. 刘思睿,赵兴丽,罗林丽,周玉锋. 2024

[9]福建省多花黄精根腐病的病原菌鉴定. 高文丽,苏海兰,林凤芳,牛雨晴,朱育菁,刘波,程曦,肖荣凤. 2024

[10]太岁中真菌菌群结构及分离菌株的DNA验证. 王朝江,王世清,高春燕,李慧,夏伟伟. 2021

[11]茶树腐皮镰刀菌拮抗菌株的筛选鉴定及促生防病特性分析. 邓晓旭,谢夏,潘娅梅,赵丰华,蒋双丰,徐文,张洁,孙润红,夏明聪,杨丽荣. 2023

[12]苹果园主要病害的发生与防治(三). 窦连登,张红军. 2010

[13]桑树根腐病真菌病原拮抗细菌JK-7的分离与鉴定. 张艳东,曹梦琪,王俊,王凯旋,孙国霞,吴福安. 2013

[14]贵州芒果畸形病病原菌的分离与鉴定. 赵玳琳,王廿,卯婷婷,陶刚. 2018

[15]基于高通量测序的青花菜早期发育小孢子转录组分析与基因功能注释. 张振超,姚悦梅,毛忠良,孙国胜,秦文斌,戴忠良. 2018

[16]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[17]紫叶紫薇新品系叶色变化转录组分析. 王莹,李玉娟,李敏,马祥建,谈峰,郭聪,张健. 2018

[18]基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化. 穆彩琴,张瑞娟,屈聪玲,韩渊怀,王兴春. 2016

[19]转录组测序(RNA-seq)策略及其数据在分子标记开发上的应用. 李小白,向林,罗洁,胡标林,田胜平,谢鸣,孙崇波. 2013

[20]黄瓜共表达基因模块的识别及其特点分析. 林行众,张忠华,杨清,黄三文. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序