北京油鸡血清IgG含量的GWAS初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张磊

作者： 张磊;刘冉冉;赵桂苹;文杰;郑麦青;吴丹;胡耀东;李鹏;刘丽

作者机构：

关键词： IgG;高密度SNP芯片;GWAS

期刊名称： 安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集

ISSN：

年卷期： 2011 年

页码： 6

收录情况： CSCD

摘要： 鸡全基因组测序草图的完成以及高通量SNP分型技术的建立,使得应用全基因组关联分析(GWAS)寻找与鸡抗病相关免疫性状功能基因成为可能。本研究组建了北京油鸡50:250个全同胞家系,利用Illumina公司的鸡60KSNP芯片对亲代和子代1004个个体进行基因型检测,通过PLINK分析软件进行全基因组范围内SNP与血清IgG含量的关联分析。结果发现,21个SNP位点全基因组水平显著和染色体水平显著,其中在22号染色体发现的5个SNPs所在0.57Mb区间内,存在两个与B淋巴细胞功能密切相关的基因:早期B细胞因子2基因(EBF-2)和钾离子通道四聚体化域9基因(KCTD9)。

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