长穗偃麦草EeSKOR基因片段的克隆、表达及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周妍彤

作者： 周妍彤;郭强;毛培春;田小霞;崔国文;孟林

作者机构：

关键词： 长穗偃麦草（Elytrigia elongata）;EeSKOR;生物信息学分析;盐胁迫

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2020 年 010 期

页码： 4686-4694

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 外整流钾离子转运蛋白（SKOR）在植物细胞抵御盐胁迫、保持胞内钾稳态过程中发挥重要作用。本研究采用RT-PCR结合RACE技术提取长穗偃麦草RNA,设计引物对长穗偃麦草EeSKOR基因的生物信息学及其表达模式进行了分析。结果表明,EeSKOR核心片段为555 bp核心氨基酸与小麦SKOR核心氨基酸同源性高达90%以上。EeSKOR片段全长cDNA为2 402 bp,编码717个氨基酸,包含2 154 bp的开放阅读框（ORF）,78 bp的5’非编码区（UTR）和170 bp的3’非编码区（UTR）。所得序列与其他植物氨基酸序列同源性均在80%以上,与小麦TaSKOR氨基酸同源性高达87.67%。EeSKOR含有SKOR类蛋白的P环结构具丝氨酸位点,并随NaCl处理浓度的增加,与对照相比,长穗偃麦草植株叶鞘和叶片中EeSKOR基因表达水平呈下降趋势,总体表现为根>叶片>叶鞘的变化趋势,说明长穗偃麦草EeSKOR基因的表达受到盐胁迫诱导和调节。

分类号： S543.9

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