湖北海棠5A基因进化与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗昌国

作者： 罗昌国;乔玉山;张计育;薛华柏;高志红;渠慎春;章镇

作者机构：

关键词： 湖北海棠;5A基因;基因进化;基因表达

期刊名称： 西北植物学报

ISSN： 1000-4025

年卷期： 2011 年 31 卷 12 期

页码： 2380-2388

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以水杨酸(SA)诱导的湖北海棠双链cDNA为模板,克隆湖北海棠5A基因并对其序列进行比对分析,用邻位法构建进化树;以根、茎、叶等器官的单链cDNA为模板、以半定量及NCBI数据库相关EST分析研究其5A基因的表达特性,以探讨湖北海棠真核生物蛋白翻译起始因子5A基因序列、表达及进化的相关信息。结果表明:(1)湖北海棠5A基因编码框长度为477个核苷酸,编码159个氨基酸,其序列与部分已报道的双子叶植物一致性达91%,与单子叶植物、细菌、古细菌、藻类一致性分别为96%、55%、70%、63%。(2)蛋白的三级结构显示湖北海棠5A蛋白与拟南芥5A蛋白也十分相似;基因进化分析显示湖北海棠5A基因沿着细菌、古细菌、藻类的进化路径,最后与月季聚在同一分枝中。(3)基因表达分析表明,湖北海棠5A基因不仅在根、茎、叶、花、果实、种子等器官中表达,而且在不同的发育时期和各种胁迫条件下表达,具有组成性表达的特点。

分类号： S661.4`Q943

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