核桃Y_2SK_2型脱水素基因JrDHN的克隆、表达和单核苷酸多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐丽

作者： 徐丽;陈新;魏海蓉;张力思;宗晓娟;王甲威;朱东姿;刘庆忠

作者机构：

关键词： 核桃;脱水素基因;定量RT-PCR;单核苷酸多态性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2014 年 41 卷 08 期

页码： 1573-1582

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用RT-PCR和RACE技术从‘香玲’核桃(Juglans regia L.‘Xiangling’)叶片中克隆了1个脱水素基因JrDHN(GenBank登录号KC503061.1),其全长1 056 bp,具有528 bp的开放阅读框,编码175个氨基酸组成的多肽,具有LEA家族成员的特征多肽序列,属于典型的Y2SK2型脱水素。以核桃18S基因为内参,对‘香玲’核桃JrDHN在4℃胁迫下的表达模式进行了初步的研究,结果表明低温诱导下叶片中JrDHN的表达增加,4℃处理4 h后达到最大值;自然越冬条件下,花芽中JrDHN表达量呈先上升后下降的趋势,在12月份表达量最高,推测JrDHN在核桃对低温胁迫响应中发挥重要功能。‘香玲’JrDHN在雌花中表达量高,其次是叶片和树皮,在花芽中最低。单核苷酸多态性分析JrDHN序列中有30个SNPs位点和11个Indels;单倍型分析显示12份核桃材料可分为10个单倍型,单倍型多样性为0.9697。

分类号： S664.1

  • 相关文献

[1]核桃JrCBF基因的克隆与表达和单核苷酸多态性分析. 徐丽,陈新,张力思,魏海蓉,刘庆忠. 2014

[2]脱水素基因转化紫花苜蓿及其初步抗旱性分析. 聂利珍,郭九峰,孙国琴,刘红葵,乔慧蕾,王蕴华,刘永志. 2013

[3]Rd29A启动子驱动AmDHN基因转化紫花苜蓿. 聂利珍,孙瑞芬,房永雨,李晓东,孙杰,韩平安. 2021

[4]蒙古冰草脱水素基因生物信息学识别及表达分析. 翟永青,马艳红,范菠菠,房永雨,张学峰,于卓,李坤,吴婧,闫秀秀,赵彦. 2024

[5]陆地棉脱水素基因GhDHN1启动子序列分析. 王俊娟,王德龙,王帅,阴祖军,王晓歌,樊伟莉,郭丽雪,郭晓宁,叶武威. 2017

[6]草莓miR390基因及其启动子的鉴定与表达分析. 李贺,毛健鑫,戚华彩,张志宏,纪明山. 2014

[7]一种筛选无青蟹呼肠孤病毒(MCRV)种蟹的荧光定量RT-PCR检测方法及其应用. 储旭,房文红,刘志强,周俊芳,李信书,李新苍. 2023

[8]甘蓝型油菜木质素合成关键基因F5H、4CL和COMT的定量表达. 李扬,顾慧,戚存扣. 2013

[9]红掌基因PFT1/MED25类基因AaPFT1的克隆与表达分析. 任保兰,牛俊海,张凌,何嘉琦,张东雪. 2016

[10]剑麻内参基因筛选与稳定表达分析. 张燕梅,王瑞芳,杨子平,鹿志伟,李俊峰,赵艳龙,陆军迎,周文钊. 2019

[11]猪ADSL基因克隆及其在部分组织中的mRNA定量表达. 刘基伟,徐日福,李奎,白丽景,应正宙,唐中林,杨述林. 2010

[12]基于SNP遗传图谱定位甘蓝型油菜千粒重QTL位点. 荐红举,魏丽娟,李超,唐章林,李加纳,刘列钊. 2014

[13]拟南芥CBF4基因位点的单核苷酸多态性(SNP)变化与抗旱表型的相应性. 郝岗平,吴忠义,陈茂盛,曹鸣庆,Dominique Brunnel,Georges Pelletier,黄丛林,杨清. 2004

[14]非标记探针HRM法在中国对虾EST-SNP筛选中的应用. 吴莹莹,孟宪红,孔杰,王清印,栾生,罗坤. 2013

[15]利用SNP分子标记分析化橘红种质资源. 赵俊生,杨晓燕,曾祥有,钟声,方静. 2016

[16]HRM分析方法中不同扩增片段、染料和仪器的比较. 饶丹,嘎利兵嘎,郭小权,张建峰,张春红,沈海燕,朱余军,刘志成,孙俊颖,郭鹏举. 2015

[17]山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究. 王德凤,杨永强,韩勇. 2013

[18]盐城地方鸡MSTN基因外显子1多态性及其与生产性能的相关性分析. 金崇富,杨智青,陈长宽,陈应江,侯福银,时凯. 2016

[19]鸡IGF1R、IGFBP-3基因SNP位点之间互作效应分析. 金崇富,陈长宽,杨智青,时凯,陈应江. 2015

[20]绵羊ME1基因第1外显子多态性与肉质性状的相关分析. 曹阳,曹阳,周国利,金海国. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序