洛河水系黄河雅罗鱼肌肉转录组测序与功能分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘亚娟
作者: 刘亚娟;孙晓辉;朱文文;赵道全;黄勇
作者机构:
关键词: 黄河雅罗鱼;肌肉组织;RNA-seq;转录组;基因调控
期刊名称: 河南水产
ISSN:
年卷期: 2025 年 003 期
页码: 13-15,19
摘要: 本研究利用RNA-seq测序技术对洛河水系黄河雅罗鱼肌肉进行转录组测序与分析。结果共获得了90,078,144条Raw Reads (原始序列数据),总碱基数为13.95 G。经数据拼装后,最终获得了125,466条Unigenes (单基因组),其长度范围在177~95,389 bp,平均长度为534 bp。这些Unigenes在六大数据库(Nr、 Swiss-Prot、 Pfam、 NOG、 GO和KEGG)都能同时被成功注释的有43,681条。GO功能结果显示:DNA模板转录的调控、细胞膜和金属离子结合注释较多。KEGG结果显示:MAPK信号通路、 Wnt信号通路和细胞自噬富集较多。这些研究结果的获得可完善洛河水系黄河雅罗鱼转录组的注释信息,也为后续进行洛河水系黄河雅罗鱼肌肉生长与发育的分子调控机制研究提供数据支撑。
分类号: S917.4
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