基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 韩明格

作者： 韩明格;韩明格;王晓歌;杨笑敏;王德龙;王俊娟;王帅;郭丽雪;樊伟丽;陈超;叶武威

作者机构：

关键词： 棉花;镉胁迫;GhHMP1;基因克隆;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 17 期

页码： 5534-5539

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1(Heavy metal transport/detoxification superfamily protein1),并从陆地棉耐镉品种‘邯242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点,对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明:陆地棉‘邯242’基因GhHMP1的CDS全长为402 bp,编码133个氨基酸,分子量约为14.88 kD,等电点为8.20;转录组和实时荧光定量分析表明,GhHMP1基因的表达具有组织特异性,且受镉胁迫诱导,可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料,从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。

分类号： S562

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