大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李胜杰

作者： 李胜杰;樊佳佳;姜鹏;白俊杰;孙建国;吴建开;费志平

作者机构：

关键词： 大口黑鲈;HSC70-1;关联分析;单核苷酸多态性;生长性状

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 74-80

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探讨HSC70-1基因对大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状的影响作用,开发与生长性状相关的分子标记,该研究采用PCR技术扩增得到HSC70-1基因的cDNA和DNA全序列,编码区cDNA序列长1 953 bp,编码650个氨基酸,其DNA全序列长3 390 bp,包含8个外显子和7个内含子。采用直接测序法在该基因上筛选到4个单核苷酸多态性(SNP)位点,分别位于核苷酸序列中的第821、第1 105、第1 200和第2 804碱基处,且处于内含子上。SNP标记与性状的关联分析结果表明,C-821G位点上CC基因型个体的体质量和全长均显著高于CG和GG基因型(P<0.05)。A-2804T位点上TT基因型个体的体质量和全长均显著高于AT和AA基因型(P<0.05)。其他位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异(P>0.05)。通过合并基因型发现,双倍型D1 (CC--CCTT)的各个生长性状表现最优,在体高和全长上显著高于D5。C-821G、A-2804T和D1与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。

分类号： S917.4

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