北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛乃琪

作者： 牛乃琪;苏艳芳;杨曼;侯欣华;王立刚;张龙超

作者机构：

关键词： 北京黑猪;HoxB9;HoxB13;脊椎数;胴体性状

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 113-121

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在对北京黑猪HoxB簇9个基因（HoxB1-7、9和13）的多态性与脊椎数和胴体性状（胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重）进行关联分析。本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对HoxB簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应（PCR）技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型，并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布，并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果，本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的（UTR）SNPs,包括HoxB2基因的1个5′UTR突变、HoxB5基因的2个3′UTR突变、HoxB9基因的2个3′UTR突变以及HoxB13基因的7个3′UTR突变。将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan′s多重检验统计分析发现，HoxB2基因的1个5′UTR突变（c.40 C＞T）、HoxB5基因的2个3′UTR突变（c.1766 A＞G、c.1767 A＞G）均与性状关联不显著（P＞0.05）;而HoxB9基因中的1个3′UTR突变（c.2743 C＞T）与胴体性状关联显著（P＜0.05）,HoxB13基因中的2个3′UTR突变（c.1863 G＞A、c.1440 A＞C）与脊椎数关联显著（P＜0.05）。综上所述，9个HoxB簇基因中仅HoxB9基因中1个3′UTR突变c.2743 C＞T与胴体性状关联显著（P＜0.05）,HoxB13基因2个3′UTR突变c.1863 G＞A、c.1440 A＞C均与脊椎数性状关联显著（P＜0.05）,这3个位点可作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点。

分类号： S828

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