新疆部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况调查及基因多态性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 郭璐

作者: 郭璐;吴小霞;段兰利;王冰洁;徐宁;阿热艾·阿哈太;乌云花;赵莉;班万里;陈云英;余婉蓉;刘帅;潘星羽;吾力江·卡马力;徐晶;穆尼拉·特列吾汗;张壮志

作者机构:

关键词: 细粒棘球蚴病;cox1基因;单倍型

期刊名称: 中国寄生虫学与寄生虫病杂志

ISSN: 1000-7423

年卷期: 2022 年 40 卷 005 期

页码: 603-609

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况和基因多态性,为该地区细粒棘球蚴病的防治提供数据参考.方法 于2020-2021年从伊宁市、阿勒泰市、塔城市、昭苏县、特克斯县、额敏县、博乐市的定点屠宰场采集屠宰后牛、羊的肝脏和肺脏,通过肉眼观察与触摸初步判定感染情况,采集疑似细粒棘球蚴包囊并提取DNA,PCR扩增细粒棘球绦虫细胞色素氧化酶1(cox1)基因并测序.从GenBank中下载细粒棘球绦虫cox1基因G1、G3、G4、G5、G6型序列,与测定的序列行BLAST比对.利用MEGA 7.0软件用邻接法构建系统进化树,用Popart软件构建cox1基因单倍型网络图,用DnaSPv5软件分析cox1基因多态性位点.使用SPSS17.0软件进行统计学分析,对不同地区牛、羊及不同脏器感染率的比较采用x2检验.结果 新疆7个县(市)共调查4 977头(只)牛、羊(牛563头、羊4 414只),采集到疑似细粒棘球蚴包囊141份,其中121份扩增出850 bp的条带并测序成功.牛、羊总感染率为2.07%(103/4 977),其中博乐市牛、羊的感染率最高(6.50%,32/492),与伊宁市(1.80%,38/2 108)、塔城市(1.14%,9/790)、特克斯县(1.06%,2/189)、额敏县(0.72%,7/970)相比,感染率差异有统计学意义(x2=49.873、33.682、8.762、28.666,均P<0.05).牛、羊的感染率分别为3.02%(17/563)、1.95%(86/4 414),两者差异有统计学意义 a2=14.296,P<0.05).共采集羊肝、肺包囊101份,其中肝包囊占42.57%(43/101),肺包囊占27.72%(28/101),肝、肺合并感染包囊占29.70%(30/101).共采集牛肝、肺包囊20份,其中肝包囊占25.00%(5/20),肺包囊占45.00%(9/20),肝、肺合并感染包囊占30.00%(6/20).BLAST比对结果显示,121条序列中120条(99.2%)与细粒棘球绦虫G1基因型序列-(MN886258.1、MG280957.1、KX020359.1和MG672143.1)的同源性为98%~100%,在系统进化树上聚为一支;1条(0.8%)与G3基因型序列(MG682532.1)的同源性为100%,在系统进化树上聚为一支.单倍型分析结果显示,cox1基因序列共有18个单倍型,Hap 1~Hap 17为G1型,Hap 18为G3型,其中Hap 1为最大的单倍型群体;18个单倍型间共有20个变异位点.序列比对结果显示,121条序列中有52条出现了碱基的转换和颠换.结论 新疆7个县(市)牛、羊细粒棘球蚴感染率存在明显差异,感染细粒棘球蚴的基因型为G1(99.2%)、G3(0.8%),有18个单倍型,Hap 1为主要致病单倍型.

分类号: R532.32

  • 相关文献

[1]新疆北疆部分地区牛羊包虫病流行病学调查与cox1和nad1基因分析. 热衣汗?玉素甫,贾万忠,闫鸿斌,吴耀东,吴燕涛,高佳敏,李莲瑞,石长青. 2020

[2]青海省细粒棘球蚴线粒体cox1基因和nad1基因多态性的研究. 马睿麟,娄忠子,李立,胡广卫,赵全邦. 2014

[3]细粒棘球蚴病的诊断与防治. 梁剑平,班旦,吴金措姆,四郎玉珍,袁振杰,格桑卓嘎,陶蕾,刘宇. 2017

[4]细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

[5]细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

[6]中华双腔吸虫线粒体cox1基因的克隆及序列分析. 王燕,刘国华,李佳缘,林少淇,林泽萍,宋此伊,周东辉. 2012

[7]青藏高原青海田鼠体内囊尾蚴分类学地位的初步研究. 范彦雷,娄忠子,李立,闫鸿斌,韩秀敏. 2014

[8]青海省高原鼠兔体内囊尾蚴分类学地位的初步研究. 范彦雷,李立,娄忠子,闫鸿斌,李建秋,刘聪暖,贾万忠. 2014

[9]新疆石河子地区鸡皮刺螨形态学鉴定及其cox1基因比对分析. 张星星,孟庆玲,乔军,刘田莉,贡莎莎,才学鹏,陈创夫. 2016

[10]鸡蛔虫线粒体cox1基因的克隆及序列分析. 李佳缘,刘国华,王燕,林宇,罗健,付汉冲,周东辉. 2012

[11]黄河宁夏段黄河鮈群体的遗传多样性与系统发育分析. 王吉祥,刘凯,王永杰,刘彦斌,刘嘉成,王彩雯,肖伟,连总强,王玉涛. 2024

[12]基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较. 孙滔,米荣升,张烨华,张世杰,张晓丽,贾海燕,曾江勇,黄燕,龚海燕,韩先干,陈兆国,赵权. 2020

[13]木薯干旱胁迫响应基因MeGSTU7自然变异分析. 王斌,曾长英,郭鑫,彭明. 2015

[14]根据EH277045衍生序列变异分析中国互花米草种群的遗传结构. 吴娟子,王强,陈建群. 2011

[15]贵州瑶山鸡线粒体DNA D-loop区序列的多态性. 韩雪,吴松成,朱丽莉,陶宇航. 2015

[16]亚洲玉米螟化性遗传规律研究. 黄艳玲,袁海滨,李启云,高月波,张正坤,王振营. 2015

[17]优质鸡MEF2A基因的SNPs检测及其与屠体性状的相关研究. 周艳,刘益平,蒋小松,杜华锐,朱庆. 2009

[18]新疆锡伯族人群线粒体DNA的遗传学分析. 于长春,李文荣,谢力,张小雷,周慧,朱泓. 2007

[19]长牡蛎酪氨酸酶基因(CgTyr1)SNP多态性与壳色性状的关联. 赵博文,李琪,王九龙,于红. 2020

[20]CYP2C19基因与药物代谢相关性研究进展. 杜红丽,王靖方,崔建勋,凌飞,魏冬青,王小宁. 2008

作者其他论文 更多>>