蕨类植物质子焦磷酸酶编码基因的鉴定及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁靖雯

作者： 梁靖雯;王鹏;叶秀旭;盖江涛;白蓓蓓;李倩;刘咲頔;徐诗涛

作者机构：

关键词： 蕨类植物;质子焦磷酸酶;结构域;进化关系

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2020 年 007 期

页码： 3168-3172

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了全面鉴定蕨类植物中质子焦磷酸酶(AVP1)编码基因,并构建家族进化关系,本研究首先通过检索PfamA数据库从AVP1蛋白序列中鉴定到了一个保守结构域,在此基础上,结合HMMER和BLAST,从6个物种基因组中鉴定到了18条质子焦磷酸酶家族基因.进化树构建结果表明,在勺叶槐叶萍中没有鉴定到AVP亚家族成员;而在细叶满江红中没有鉴定到AVPL亚家族成员.本研究为今后针对蕨类植物中AVP1基因功能的深入研究提供了基因靶标.

分类号： Q943.2

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