TLR4基因SNP检测及在中外鸡种中的群体变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋咏梅

作者： 宋咏梅;庞建建;赵桂苹;刘冉冉;李鹏;赵兴旺;郑麦青;文杰

作者机构：

关键词： 鸡;TLR4;SNP;遗传多样性

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2010 年 26 卷 16 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心

摘要： 以9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和3个引进品种(隐性白羽肉鸡、科宝鸡、来航蛋鸡)为素材,利用DNA直接测序技术对Toll样受体4(TLR4)蛋白基因(登陆号为AY064697)的全部外显子、部分内含子及5’调控区共4373bp的序列进行单核苷酸多态性检测,共检测到36个SNPs,其中19个SNPs位于编码区(cSNPs),12个集中于第三外显子的特定区域上(蛋白的TRR结构域);10个为错义突变,21个为新发现的SNPs。对集中于第三外显子上的12个SNP位点,在12个品种的688个个体进行了PCR-SBT检测,这些SNPs产生的不同基因型及等位基因在12个鸡品种间分布存在显著的差异,推测与该基因的功能存在相关。

分类号： S831.2

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