狂犬病病毒CVS株糖蛋白、核蛋白生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李江涛

作者: 李江涛;殷相平;张金卫;丁农;柳纪省

作者机构:

关键词: 狂犬病毒;糖蛋白;核蛋白;二级结构;B细胞表位

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2010 年 0 卷 07 期

页码: 179-184

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对狂犬病毒(rabies virus,RV)CVS株糖蛋白、核蛋白基因进行了克隆与测序,推导出相应的氨基酸序列。后采用Gamier-Robson方法和Chou-Fasman方法预测了蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle方法对蛋白的亲水性进行了分析,用Emi-ni方法预测了蛋白的表面可能性,以Jameson-Wolf方法预测了蛋白的抗原指数;综合分析预测蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,糖蛋白在序列的121-126、133-137、161-165、191-193、201-204、214-216、221-225、264-267区域,核蛋白在序列的143-152、166-172、263-273、411-427区域或其附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。

分类号: S852.65

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