猪CREBRF基因生物信息学和表达规律分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭肖蓉

作者： 郭肖蓉;刘颖;樊佳珍;黄涛;周荣

作者机构：

关键词： 猪;卵巢;CREBRF;生物信息学分析;基因表达

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2024 年 26 卷 009 期

页码： 44-53

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CREBRF基因在雌性动物生殖过程中具有重要调控作用，为了深入了解猪的CREBRF基因特征和功能，对CREBRF基因进行生物信息学分析，并通过RT-qPCR分析不同阶段巴马猪卵巢组织中CREBRF的表达规律。结果显示，在5个品种猪基因组上鉴定到20个CREBRF基因的碱基突变，其中7个为同义突变，13个为错义突变。猪CREBRF基因的CDS区全长1 920 bp，共编码639个氨基酸，不稳定系数较高，为亲水性蛋白，有85个高置信度的磷酸化位点和4个糖基化位点，且CREBRF的mRNA具有20个高可信度的m6A甲基化修饰位点，猪、人和小鼠中的CREBRF蛋白保守性较强。RT-qPCR结果显示，猪卵巢中CREBRF基因的表达量在猪出生0和28 d时表达水平较高，随着猪生长发育，在出生180 d时表达量显著降低，在母猪妊娠38和80 d时CREBRF的表达再次升高。通过比对不同品种猪中CREBRF基因CDS区的碱基突变并分析该基因的理化性质及表达规律，发现了CREBRF基因在猪胎儿期、出生早期和妊娠期卵巢组织中的高表达，推测CREBRF在母猪生殖过程中起重要作用，为猪高繁殖力基因挖掘和分子标记开发提供参考。

分类号： S828

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