芒果CCR基因的克隆及其序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张宇

作者： 张宇;张波;赵志常;高爱平;陈业渊;黄建峰;党志国;罗睿雄

作者机构：

关键词： 芒果;肉桂酰辅酶A还原酶;基因克隆;序列分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2014 年 29 卷 S1 期

页码： 16-19

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究芒果CCR基因在芒果对芒果树抗性的功能。采用传统的RT-PCR和RACE方法从芒果的枝梢中克隆得到了1个参与木质素生物合成的肉桂酰辅酶-A还原酶基因(CCR)的全长c DNA序列,进而对得到的序列采用TMHMM、DNAMAN等软件进行生物信息学分析,发现芒果CCR基因包含编码区、3'和5'非翻译区的长度为1 292 bp的c DNA序列,编码305个氨基酸;对跨膜结构域进行了预测,发现该基因无跨膜结构域;蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-螺旋为主;聚类分析发现,该基因与美洲山杨木、油茶等植物的亲缘关系较近,而与百合、橡胶树等亲缘关系较远。从芒果中克隆得到了一个CCR基因,并对其生物信息学进行了分析,为后续转基因工作打下了基础。

分类号： S667.7

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