6个地方鸡种线粒体CO Ⅰ基因的DNA条形码
文献类型: 中文期刊
第一作者: 高玉时
作者: 高玉时;屠云洁;童海兵;王克华;陈宽维;顾荣
作者机构:
关键词: 地方鸡种;鉴定;COⅠ基因;DNA条形码
期刊名称: 农业生物技术学报
ISSN: 1006-1304
年卷期: 2007 年 15 卷 06 期
页码: 18-24
收录情况: CSCD
摘要: 以我国6个地方鸡(Gallus gallus)品种为研究对象,利用DNA测序技术测定了线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ(cytochrome coxidaseⅠ,COⅠ)基因的2段序列,研究COⅠ这一特定基因的特定区段作为DNA条形码在识别地方鸡种方面的可行性和有效性。研究结果表明,所选择的2段序列中,经过多态性分析筛选,以Bar1序列(712~1359位)突变位点较多,为24个,为24种单倍型,其中22种单倍型为6个鸡品种所特有;品种间平均多态性3.860%,6个鸡品种均有其特异位点;6个品种的NJ聚类分析结果显示,6个鸡品种基本被聚为不同的类别,与形态学分类基本一致,COⅠ基因的Bar1序列用于这些品种鉴定是可行的。而对Bar2序列(1800~2314位)进行序列多态性分析,只发现5个突变位点,为5种单倍型,且大多品种没有其特异位点。由于其多态性低,且NJ聚类分析6个品种的聚类结果与形态学分类不一致,Bar2序列不利于品种鉴定。研究结果表明,COⅠ基因的Bar1序列更适合地方鸡品种鉴定条形码。
分类号: S831`Q78
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