中国普通野生稻与栽培稻种SSR多样性的比较分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张晓丽

作者： 张晓丽;郭辉;王海岗;吕建珍;袁筱萍;彭锁堂;魏兴华

作者机构：

关键词： 普通野生稻;栽培稻;地方品种;选育品种;遗传多样性;分子方差分析

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2008 年 34 卷 04 期

页码： 591-597

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用48对SSR引物对288份我国普通野生稻和栽培稻的遗传多样性进行比较分析。结果显示,共检测到505个等位基因,每个位点的等位基因数变幅为5～20,平均10.5个;平均Nei基因多样性指数(He)为0.731,变幅为0.384(RM409)～0.905(RM206)。普通野生稻遗传多样性高于栽培稻种,栽培稻等位基因数和平均Nei基因多样性指数分别为普通野生稻的70.2%和88.2%,其中,栽培稻地方品种和选育品种等位基因数分别为普通野生稻的65.4%和53.0%,选育品种等位基因数仅为地方品种的81.1%。AMOVA分析表明,总变异的10.3%是由于种间SSR遗传差异所引起的,不同SSR位点种间的分化程度不同,在0.7%～46.3%之间,有43个位点种间遗传分化达到显著水平,其中以RM427分化最为明显,达46.3%。聚类分析表明,中国普通野生稻总体偏粳,极少数广东、海南材料偏籼。

分类号： S511.9

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