粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 乔麟轶
作者: 乔麟轶;李欣;畅志坚;张晓军;詹海仙;郭慧娟;李建波;常建忠;郑军
作者机构:
关键词: 粗山羊草;生长素;Aux/IAA基因家族;染色体定位;生物信息学
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2014 年 40 卷 12 期
页码: 2059-2069
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 生长素是植物生长发育过程中的关键激素之一,Aux/IAA家族基因是重要的生长素原初响应基因。通过生物信息学方法从粗山羊草(Aegilops tauschii)全基因组中分离出28个Aux/IAA基因,其中20个粗山羊草Aux/IAA蛋白具有4个保守结构域;28个Aux/IAA基因分布于全部7对染色体上,5个基因分别具有位于同一位点的已知标记。粗山羊草IAA3、IAA11和IAA26的表达具有组织特异性,分别在雌蕊、种子和根中特异表达。系统发育显示,11对粗山羊草-乌拉尔图小麦Aux/IAA蛋白、5对粗山羊草-大麦Aux/IAA蛋白直系同源。共线性分析表明,粗山羊草Aux/IAA基因与短柄草、水稻中同源基因具有很好的共线性。本研究分离的相关基因不仅可用于小麦的遗传改良,也为深入研究小麦Aux/IAA基因提供了信息。
分类号: Q943
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