基于DGGE和T-RFLP分析采食不同粗饲料梅花鹿瘤胃细菌区系

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李志鹏

作者： 李志鹏;姜娜;刘晗璐;崔学哲;荆祎;杨福合;李光玉

作者机构：

关键词： 梅花鹿;细菌区系;普雷沃氏菌;单宁

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2014 年 47 卷 04 期

页码： 759-768

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】细菌区系在梅花鹿(Cervus nippon)瘤胃发酵中发挥着重要作用,然而有关梅花鹿瘤胃细菌区系的研究鲜有报道。研究梅花鹿瘤胃细菌区系,为梅花鹿瘤胃发酵调控提供分子生物学依据。【方法】选取4头2岁龄的装有永久性瘤胃瘘管的成年雄性梅花鹿为研究对象,分别饲喂以柞树叶(OL组,梅花鹿A和B)和玉米秸秆(CS组,梅花鹿C和D)为主要粗饲料的日粮,持续饲喂30 d。通过瘤胃瘘管取瘤胃内固液混合物,提取瘤胃微生物基因组DNA。扩增瘤胃细菌16S rRNA基因V3区以及16S rRNA基因,分别用于DGGE和T-RFLP分析。DGGE图谱进行聚类分析,并切取优势条带进行克隆测序,鉴定瘤胃内细菌组成。根据T-RFLP图谱结果计算细菌群落的多样性、优势度、均匀度和丰富度,通过Microbial Community AnalysisⅢ(MiCAⅢ)数据库推测T-RFs可能代表的微生物种类,并进行T-RFLP图谱的聚类分析。【结果】DGGE图谱聚类表明,CS组和OL组瘤胃细菌区系相似性低于65%,表明粗饲料种类影响梅花鹿瘤胃细菌区系。OL组梅花鹿A和B的DGGE图谱相似度大于70%,CS组梅花鹿C和D的DGGE图谱相似性大于75%,而且同组不同个体之间瘤胃细菌区系存在差异。OL组和CS组分别获得20和24个DGGE特异性条带。序列分析表明,CS组条带可归类为拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门,而OL组条带可归类为拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和互养菌门。OL组与CS组中存在大量Prevotella spp.,但不同组中Prevotella spp.在种水平组成不同,主要纤维降解菌为Clostridium spp.与Eubacterium spp.。T-RFLP结果显示,梅花鹿D(CS组)具有最高的丰富度、多样性、均匀度和最低的优势度,梅花鹿A和B的各项指数相近但低于梅花鹿D,说明OL组中的粗饲料(柞树叶)影响瘤胃中微生物的相对生物量。梅花鹿C和D的各项指数相差较大而且梅花鹿C的指数低于梅花鹿A和B,表明同组不同个体之间存在差异。81、214、272和308 bp的T-RFs为OL组优势条带,90、95、175、273和274 bp的T-RFs为CS组优势条带,161、259、264、266和284 bp的T-RFs为共同条带。根据MiCAⅢ结果,这些T-RFs代表细菌归类于拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和酸杆菌门。T-RFs图谱聚类表明,4头梅花鹿T-RFs聚为两类,粗饲料来源影响梅花鹿瘤胃细菌T-RFs图谱特征,其中梅花鹿A、B和C的T-RFs特征条带图谱相似。【结论】Prevotella spp.是梅花鹿瘤胃优势细菌,但不同粗饲料影响梅花鹿瘤胃细菌区系组成。

分类号： S825

  • 相关文献

[1]基于16SrRNA基因序列分析梅花鹿瘤胃细菌多样性. 李志鹏,刘晗璐,崔学哲,荆祎,鲍坤,徐超,杨福合,李光玉. 2013

[2]基于16S rRNA基因序列分析梅花鹿瘤胃细菌多样性. 李志鹏,刘晗璐,崔学哲,荆祎,鲍坤,徐超,杨福合,李光玉. 2013

[3]单宁对育成期梅花鹿采食量和蛋白质代谢率的影响. 杨镒峰,魏海军,李光玉,宋兴超,郑策,陈秀敏. 2010

[4]日粮单宁水平对育成期雄性梅花鹿生长发育、角基萌发和初角茸生长的影响. 杨镒峰,陈秀敏,赵伟刚,赵蒙,薛海龙,李光玉,魏海军. 2015

[5]不同单宁水平日粮对育成前期雄性梅花鹿生长和血液生化指标的影响. 杨镒峰,魏海军,李光玉,崔学哲,赵蒙,赵伟刚,薛海龙. 2010

[6]中草药提取物复合制剂对乳中高体细胞数奶牛生产性能、免疫和抗氧化功能及瘤胃细菌区系的影响. 张腾龙,郭晨阳,宋洁,敖长金,王丽芳. 2023

[7]转crylAb基因克螟稻对根际可培养细菌类群的影响. 唐健,江云珠,彭于发. 2009

[8]燕麦草在奶牛瘤胃中的降解规律与黏附细菌区系变化. 郑会超,郭晓辉,蒋永清,孙富祥,孙伦. 2023

[9]饲粮精粗比对泌乳水牛瘤胃细菌和甲烷菌区系的影响. 林波,梁辛,李丽莉,韦升菊,李萍,邹彩霞. 2016

[10]开食料中玉米和全脂大豆的蒸汽压片或膨化处理对犊牛瘤胃挥发酸比例和细菌区系的影响. 张元庆,孟庆翔,贺东昌,杨效民,王芳,张红岗,上官明军,张变英. 2010

[11]槟榔间作香露兜模式下土壤微生物区系分析. 张昂,钟壹鸣,鱼欢,吉训志,宗迎,贺书珍,秦晓威. 2022

[12]甘氨酸铜对仔猪粪铜含量及粪便细菌区系的影响. 李荣杰,陆扬,胡二永,字正浩,孙国荣,夏东. 2014

[13]板栗果肉褐变原因初探(简报). 黄品湖,郭秀珠,叶茂宗,陶月良,贾守菊. 2001

[14]不同添加剂对刺梨果汁品质稳定性的影响. 梁芳,高霞,杨雪,廉勇,丁筑红. 2011

[15]发酵鱼粉中寡肽的测定. 罗钦,罗土炎,宋永康,饶秋华,涂杰峰. 2012

[16]菜籽粕中抗营养因子及其去除方法的研究进展. 金晶,徐志宏,魏振承,池建伟,刘军. 2009

[17]果蔬中单宁测定技术研究. 伍云卿,涂杰峰,范超. 2015

[18]植物单宁及其对牧草品质的影响研究进展 Ⅲ.单宁对牧草品质和反刍动物养殖的影响. 潘伟彬,黄毅斌. 2008

[19]单宁降解菌的筛选及降解研究. 乔家运,李平,陈龙宾,王文杰. 2011

[20]涩柿的脱涩方法. 张雪丹,张倩,杨娟侠,王传增,王丹. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序